62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12956 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12956  transmembrane transport protein mmpL7  100 
 
 		 920 aa  1810    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11778  MmpL family membrane protein  28.76 
 
 		 945 aa  249  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000786949  decreased coverage  0.0000000000113435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3435  transport protein  25.29 
 
 		 968 aa  214  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3189  transport protein  25.27 
 
 		 968 aa  212  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  24 
 
 		 964 aa  211  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  25.43 
 
 		 967 aa  207  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  24.46 
 
 		 941 aa  206  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  24.3 
 
 		 945 aa  205  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  24.3 
 
 		 945 aa  205  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5263  transport protein  24.97 
 
 		 968 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5555  transport protein  24.97 
 
 		 968 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5174  transport protein  24.97 
 
 		 968 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  26.02 
 
 		 962 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  23.72 
 
 		 948 aa  192  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  24.45 
 
 		 963 aa  192  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10407  transmembrane transport protein mmpL1  24.39 
 
 		 958 aa  188  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.665513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  24.33 
 
 		 1001 aa  187  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  23.37 
 
 		 968 aa  187  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  23.38 
 
 		 959 aa  179  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  22.72 
 
 		 968 aa  173  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  24.66 
 
 		 955 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  24.66 
 
 		 955 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  24.66 
 
 		 955 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  23.96 
 
 		 944 aa  165  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  23.26 
 
 		 1022 aa  144  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  23.26 
 
 		 1022 aa  144  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  24.07 
 
 		 1040 aa  127  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  25.13 
 
 		 1013 aa  127  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  24.01 
 
 		 1002 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  22.82 
 
 		 1146 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  23.58 
 
 		 1028 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  23.31 
 
 		 1013 aa  114  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  24.08 
 
 		 1077 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  23.72 
 
 		 998 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  24.77 
 
 		 1000 aa  112  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  24.22 
 
 		 1089 aa  112  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  23.72 
 
 		 998 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  23.72 
 
 		 998 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  23.82 
 
 		 1062 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  23.82 
 
 		 1062 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  26.48 
 
 		 681 aa  99  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  26.35 
 
 		 1003 aa  97.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  24.3 
 
 		 1011 aa  94.4  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2705  transport protein  31.93 
 
 		 957 aa  77.8  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  22.73 
 
 		 1001 aa  74.3  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4635  MMPL domain-containing protein  26.24 
 
 		 470 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  24.04 
 
 		 1049 aa  61.6  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  24.91 
 
 		 981 aa  53.9  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11589  transmembrane transport protein mmpL6  27.24 
 
 		 397 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9101799999999998e-86  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  22.4 
 
 		 1246 aa  52  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0890  MMPL domain protein  20.19 
 
 		 1026 aa  50.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000250771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  21.5 
 
 		 1040 aa  48.1  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  19.92 
 
 		 1038 aa  47  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  31.49 
 
 		 1068 aa  46.6  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  20.44 
 
 		 1038 aa  47  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  25.23 
 
 		 1054 aa  45.8  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  28.13 
 
 		 699 aa  45.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  19.12 
 
 		 1041 aa  45.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  31.67 
 
 		 713 aa  44.7  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  21.86 
 
 		 1038 aa  44.7  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  20.16 
 
 		 1038 aa  44.3  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1002 aa  44.3  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>