110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1052 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  100 
 
 		 173 aa  345  1e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  100 
 
 		 173 aa  345  1e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  85.38 
 
 		 172 aa  298  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  85.38 
 
 		 172 aa  298  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  78.36 
 
 		 172 aa  288  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  79.07 
 
 		 173 aa  285  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  80.12 
 
 		 172 aa  283  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  75.44 
 
 		 172 aa  274  4e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  73.41 
 
 		 173 aa  273  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  74.27 
 
 		 172 aa  270  5.000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  72.25 
 
 		 173 aa  270  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  73.1 
 
 		 172 aa  270  1e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  60.82 
 
 		 172 aa  227  5e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  63.53 
 
 		 172 aa  226  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  50.28 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  52.84 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  50.28 
 
 		 193 aa  181  6e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  49.73 
 
 		 184 aa  179  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  51.37 
 
 		 184 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  49.18 
 
 		 184 aa  178  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  49.44 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  52.02 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  48.04 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  50.57 
 
 		 181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  46.96 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  50 
 
 		 182 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  50 
 
 		 182 aa  160  7e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  46.41 
 
 		 169 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  48.12 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  46.27 
 
 		 169 aa  127  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  45.07 
 
 		 169 aa  127  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  45.07 
 
 		 169 aa  127  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  42.07 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  40.85 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  40.85 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  40.24 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  40.24 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  40.85 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  40.24 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  43.97 
 
 		 169 aa  120  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  40.85 
 
 		 161 aa  120  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  39.52 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  38.12 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  45.52 
 
 		 169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  44.63 
 
 		 174 aa  117  9e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  36.75 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  39.02 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  44.63 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  43.66 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  36.75 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  36.14 
 
 		 161 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  35.33 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  36.14 
 
 		 161 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  36.14 
 
 		 161 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  37.41 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  33.53 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  34.15 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  32.93 
 
 		 161 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  34.15 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  34.75 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  34.75 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  36.23 
 
 		 163 aa  100  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  34.53 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  31.25 
 
 		 161 aa  98.2  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  33.8 
 
 		 161 aa  97.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  33.33 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  33.33 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  33.33 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  32.37 
 
 		 132 aa  88.2  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  33.55 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  33.99 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  23.9 
 
 		 194 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  29.32 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  23.53 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  34.65 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  25.29 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  30.16 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  28.03 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  27.82 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  27.54 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  28.15 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  28.15 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  26.81 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  23.4 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  27.56 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  26.49 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  27.37 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  25.53 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  28.15 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  28.99 
 
 		 163 aa  52  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  28.99 
 
 		 163 aa  52  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  25 
 
 		 162 aa  52  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  23.19 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  25.83 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  24.06 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  23.35 
 
 		 1100 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  24.81 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  24.81 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  23.88 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  23.89 
 
 		 162 aa  44.3  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>