237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0829 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0829  lipoproteins-like  100 
 
 		 110 aa  228  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1256  rare lipoprotein A  41.96 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2949  Rare lipoprotein A  40.18 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3147  Rare lipoprotein A  40.18 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000599592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  47.13 
 
 		 358 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  40.54 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  42.7 
 
 		 360 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  42.7 
 
 		 360 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  41.35 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  44.19 
 
 		 367 aa  60.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0749  rare lipoprotein A  44.32 
 
 		 330 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  46.75 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0269  rare lipoprotein A  44.05 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.586864 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  36.46 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  38.2 
 
 		 249 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  33.98 
 
 		 249 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0534  rare lipoprotein A  47.14 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6400  rare lipoprotein A  49.3 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0555  rare lipoprotein A  44.05 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0175  rare lipoprotein A  42.86 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  39.33 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  38.37 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  40.45 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0747  rare lipoprotein A, putative  46.05 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479565  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  35.2 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0676  rare lipoprotein A  41.49 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  38.61 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  46.43 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  39.78 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0178  rare lipoprotein A  41.67 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  36.46 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  40.23 
 
 		 335 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0699  rare lipoprotein A  47.14 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  43.75 
 
 		 204 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  34.95 
 
 		 264 aa  53.9  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  43.18 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  45 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0403  hypothetical protein  41.11 
 
 		 182 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.06763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  37.86 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0428  rare lipoprotein A  44.29 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0615  rare lipoprotein A  40 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.679180000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0313  rare lipoprotein A  42.11 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  43.06 
 
 		 198 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  35.56 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  39.33 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  38.61 
 
 		 221 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  37.21 
 
 		 275 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  39.33 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  37.08 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  37.08 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  36.67 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  43.18 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  33.33 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  37.21 
 
 		 275 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  40.62 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  40.45 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  48.44 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0601  rare lipoprotein A  40 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000191646  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  34.88 
 
 		 239 aa  52.4  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  40.62 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  37.08 
 
 		 238 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  38.1 
 
 		 206 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  38.64 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  41.57 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  33.33 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  33.72 
 
 		 279 aa  51.6  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  37.21 
 
 		 266 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  42.05 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  45.95 
 
 		 358 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  48.44 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  36.63 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  42.05 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  41.67 
 
 		 206 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5674  rare lipoprotein A  48.39 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  37.5 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  33.33 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  34.04 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  36.67 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  38.89 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  38.89 
 
 		 230 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  28.46 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  34.44 
 
 		 270 aa  50.8  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1025  rare lipoprotein A  33.33 
 
 		 202 aa  50.4  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  38.89 
 
 		 230 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  38.37 
 
 		 285 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  33.33 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  38.89 
 
 		 242 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  32.99 
 
 		 163 aa  50.4  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  38.89 
 
 		 211 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  32.98 
 
 		 170 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  38.89 
 
 		 211 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  40.66 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  37.35 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  36.96 
 
 		 324 aa  50.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  38.89 
 
 		 211 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  38.89 
 
 		 242 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 342 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  37.08 
 
 		 124 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0455  lipoprotein A domain-containing protein  37.08 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  35.96 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>