More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0516 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  100 
 
 
440 aa  892    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  52.51 
 
 
446 aa  458  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  54.84 
 
 
431 aa  450  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  48.86 
 
 
447 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  49.28 
 
 
434 aa  410  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  46.5 
 
 
458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  46.5 
 
 
458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  47.28 
 
 
440 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  46.01 
 
 
428 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  44.84 
 
 
430 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  44.6 
 
 
430 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  44.47 
 
 
427 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  45.15 
 
 
429 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  48.01 
 
 
434 aa  362  9e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  44.1 
 
 
425 aa  361  1e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  43.41 
 
 
430 aa  360  3e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  44.04 
 
 
426 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  44.02 
 
 
449 aa  347  2e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  44.27 
 
 
453 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  45.66 
 
 
410 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  43.75 
 
 
450 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  45.6 
 
 
444 aa  332  7.000000000000001e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  42.63 
 
 
444 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  42.89 
 
 
444 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  42.63 
 
 
444 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  41.1 
 
 
433 aa  320  5e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  46.76 
 
 
413 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  46.76 
 
 
413 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  40.29 
 
 
417 aa  312  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07361  carboxyl-terminal processing protease  40.15 
 
 
434 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775451 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  41.64 
 
 
434 aa  309  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  40.38 
 
 
413 aa  305  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  44.31 
 
 
412 aa  305  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  40.9 
 
 
407 aa  298  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2052  carboxyl-terminal protease  41.69 
 
 
416 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.774311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  44.61 
 
 
409 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  37.9 
 
 
389 aa  246  8e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  35.87 
 
 
429 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  34.48 
 
 
428 aa  226  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  34.77 
 
 
431 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  32.75 
 
 
436 aa  223  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  35.53 
 
 
394 aa  221  3e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  33.16 
 
 
418 aa  220  5e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  36.43 
 
 
410 aa  219  7.999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  33.52 
 
 
446 aa  219  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  34.78 
 
 
429 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  33.62 
 
 
427 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37419  D1 proceesing peptidase  38.57 
 
 
446 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299887  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  33.63 
 
 
457 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  32.43 
 
 
436 aa  210  5e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  35.47 
 
 
418 aa  205  2e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  39.03 
 
 
383 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  40.26 
 
 
438 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  40.26 
 
 
438 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  39.6 
 
 
438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  34.43 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  31.61 
 
 
398 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 
476 aa  196  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  31.9 
 
 
554 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  30.69 
 
 
423 aa  196  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  38.61 
 
 
437 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  35.79 
 
 
377 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  37.95 
 
 
438 aa  194  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  30 
 
 
401 aa  192  8e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  32.4 
 
 
442 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  32.97 
 
 
417 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  33.9 
 
 
401 aa  190  5e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  36.63 
 
 
445 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46670  predicted protein  35.24 
 
 
476 aa  189  5.999999999999999e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698625  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  36.63 
 
 
445 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  36.54 
 
 
428 aa  189  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  37.42 
 
 
426 aa  189  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  37.25 
 
 
439 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  33.76 
 
 
400 aa  188  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  34.69 
 
 
440 aa  188  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  36.54 
 
 
433 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  37.75 
 
 
436 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  37.75 
 
 
436 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  37.07 
 
 
424 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  36.33 
 
 
439 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  33.66 
 
 
426 aa  187  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  37.16 
 
 
494 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  35.1 
 
 
462 aa  187  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  34.14 
 
 
423 aa  186  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  37.07 
 
 
424 aa  186  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  30.92 
 
 
475 aa  186  6e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  36.01 
 
 
457 aa  186  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  32.61 
 
 
429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  35.96 
 
 
389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  32.48 
 
 
459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 
445 aa  184  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  35.37 
 
 
442 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  30.68 
 
 
443 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  34.67 
 
 
383 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  36.34 
 
 
440 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  36.88 
 
 
710 aa  183  6e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  30.29 
 
 
415 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  35.64 
 
 
428 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  32.04 
 
 
455 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  37.18 
 
 
434 aa  180  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>