128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2302 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2302  D-amino acid oxidase  100 
 
 		 302 aa  601  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2673  D-amino acid oxidase  62.67 
 
 		 350 aa  371  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30031  NAD binding site:D-amino acid oxidase  51.31 
 
 		 372 aa  306  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18391  NAD binding site:D-amino acid oxidase  44.97 
 
 		 371 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.299081  normal  0.626898 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21851  NAD binding site:D-amino acid oxidase  36.45 
 
 		 370 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1312  FAD dependent oxidoreductase  35.45 
 
 		 368 aa  225  6e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1796  D-amino acid oxidase  30.79 
 
 		 360 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229908  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19131  NAD binding site:D-amino acid oxidase  29.8 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.119558  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18941  NAD binding site:D-amino acid oxidase  30.13 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18941  NAD binding site:D-amino acid oxidase  29.19 
 
 		 360 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0520  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 369 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0537  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 369 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1677  hypothetical protein  31.03 
 
 		 365 aa  112  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 360 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 379 aa  99  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0199  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 366 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 385 aa  79.3  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1793  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 389 aa  79  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.075637  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  23.91 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  30.99 
 
 		 440 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  30.99 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  34.23 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  30.41 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  30.73 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  28.57 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  33.12 
 
 		 367 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  32.1 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  29.49 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  30.8 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  37.4 
 
 		 652 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  29.19 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  30.36 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  33.02 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 		 365 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  29.75 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  25.5 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.5 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.5 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  24.41 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  31.01 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  25 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  25.5 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  34.85 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  27.49 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  30 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  28.85 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  30.49 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  25.5 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.69 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  26.62 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  25.76 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  26.85 
 
 		 369 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 666 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  28.28 
 
 		 406 aa  57  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  24.32 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  27.89 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  24.32 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3659  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  36.43 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  35.25 
 
 		 666 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  28.96 
 
 		 375 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.21 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  25.68 
 
 		 398 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.58 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  28.74 
 
 		 365 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  30.48 
 
 		 1033 aa  53.5  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  28.83 
 
 		 375 aa  53.1  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  32.54 
 
 		 392 aa  52.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  30 
 
 		 361 aa  52.8  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  24.76 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.27 
 
 		 369 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  29.87 
 
 		 371 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  35.82 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  29.68 
 
 		 368 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4194  D-amino acid dehydrogenase small subunit  22.71 
 
 		 419 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  29.71 
 
 		 404 aa  50.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  26.6 
 
 		 391 aa  50.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2597  D-amino-acid dehydrogenase  27.71 
 
 		 417 aa  49.7  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  32.59 
 
 		 379 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1542  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.37 
 
 		 420 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.224585  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  34.09 
 
 		 355 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  26.91 
 
 		 371 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  36.27 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  28.24 
 
 		 372 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 374 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 374 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 390 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2587  D-amino-acid dehydrogenase  26.09 
 
 		 415 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 		 377 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 363 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  29.11 
 
 		 363 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  37.37 
 
 		 384 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>