70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1415 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1415  cytochrome c class I  100 
 
 		 123 aa  257  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2649  cytochrome c, class IC  45.71 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3282  cytochrome c, class IC  41.9 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243795  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0148  cytochrome c, class I  42.05 
 
 		 248 aa  67  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6691  hypothetical protein  38.64 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1272  cytochrome c, class I  27.27 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.139813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3248  cytochrome c, class I  27.27 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517083  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1391  cytochrome c, class I  29.82 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  33.02 
 
 		 314 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4638  cytochrome c, class I  30.63 
 
 		 361 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2376  hypothetical protein  35.63 
 
 		 224 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256417  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4136  cytochrome c class I  31.82 
 
 		 286 aa  51.2  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1402  hypothetical protein  27.27 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal  0.402158 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  28.57 
 
 		 653 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  32.97 
 
 		 254 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  32.18 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  29.9 
 
 		 388 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  31 
 
 		 657 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2157  hypothetical protein  23.71 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.580825  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  32.1 
 
 		 637 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  30.36 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  29.47 
 
 		 296 aa  45.1  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2859  hypothetical protein  28.28 
 
 		 307 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0235479 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  34.25 
 
 		 254 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  31.33 
 
 		 388 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4116  cytochrome c class I  30.19 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115646 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0573  cytochrome c, class I  26.26 
 
 		 196 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0439994  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  31.33 
 
 		 388 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1741  cytochrome c, class I  25.76 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  30 
 
 		 647 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  32.95 
 
 		 203 aa  42.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2513  cytochrome c family protein  31.68 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2134  cytochrome c family protein  23.68 
 
 		 103 aa  42.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  31.82 
 
 		 643 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  29.21 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0537  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.45 
 
 		 292 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.931468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2348  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.43 
 
 		 290 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.765339  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3661  hypothetical protein  27.17 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  31.43 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2138  cytochrome c family protein  23.68 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.203882 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2244  cytochrome c class I  23.68 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  26.14 
 
 		 394 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0693  Cbb3-type cytochrome c oxidase CcoP subunit  28.43 
 
 		 290 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  34.02 
 
 		 220 aa  41.6  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5705  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.25 
 
 		 433 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0776178 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.34 
 
 		 422 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0462  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29 
 
 		 294 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528353  normal  0.120204 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  26.14 
 
 		 394 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1897  secretion protein HlyD  28.97 
 
 		 485 aa  41.2  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  28 
 
 		 683 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  28.89 
 
 		 430 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  26.09 
 
 		 394 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  26.09 
 
 		 394 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0850  hypothetical protein  30.43 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  28.74 
 
 		 395 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3662  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.87 
 
 		 294 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.21 
 
 		 426 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2780  cytochrome c class I  24.49 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  29.59 
 
 		 644 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3126  cytochrome c class I  29.46 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549907 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  29.81 
 
 		 320 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  30 
 
 		 652 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  26.09 
 
 		 393 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2959  cytochrome c class I  43.24 
 
 		 571 aa  40.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  26.14 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4873  cytochrome c class I  51.35 
 
 		 306 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3273  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.04 
 
 		 293 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3786  cytochrome c class I  27.08 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117464  normal  0.511619 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4062  cytochrome c class I  27.08 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  28.57 
 
 		 649 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>