More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18020 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_18020  sugar kinase, ribokinase  100 
 
 		 306 aa  596  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15170  sugar kinase, ribokinase  49.84 
 
 		 316 aa  269  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2923  carbohydrate kinase, PfkB  49.01 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4135  PfkB  47.85 
 
 		 306 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0867142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3478  PfkB domain protein  52.87 
 
 		 327 aa  246  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  45.73 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06080  sugar kinase, ribokinase  43.05 
 
 		 303 aa  195  8.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08200  sugar kinase, ribokinase  40.38 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0290  kinase, PfkB family  29.83 
 
 		 374 aa  140  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2380  kinase, PfkB family  31.19 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2287  kinase, PfkB family  31.19 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1001  PfkB domain protein  31.8 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2331  kinase PfkB family  31.19 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2488  PfkB family kinase  31.19 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2376  kinase, PfkB family  31.19 
 
 		 321 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3080  kinase, PfkB family  29.93 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0595039 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  35.22 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3309  PfkB domain protein  30.2 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2236  PfkB family kinase  31.44 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  35.31 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  31.21 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  31.72 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  33.23 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  33.23 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  32.91 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1089  ribokinase family sugar kinase  29.54 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0219735  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3608  PfkB domain protein  31.62 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  34.08 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  27.85 
 
 		 311 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  35.14 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  35.33 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0963  PfkB family kinase  31.1 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964628 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  30.23 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1557  PfkB domain protein  30.77 
 
 		 321 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2389  PfkB family kinase  29.83 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  32.81 
 
 		 306 aa  102  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02028  predicted kinase  30.77 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01992  hypothetical protein  30.77 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  32.37 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  32.06 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  30.89 
 
 		 305 aa  99.8  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  30.06 
 
 		 403 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  31.31 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30.29 
 
 		 305 aa  98.2  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0159  ribokinase-like domain-containing protein  27.65 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0624  ribokinase-like domain-containing protein  34.63 
 
 		 313 aa  97.4  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311973 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  31.92 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2216  ribokinase, putative  25.76 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.442783  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  31.65 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  32.09 
 
 		 305 aa  97.4  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  31.73 
 
 		 310 aa  96.3  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1470  ribokinase family sugar kinase  25.61 
 
 		 291 aa  96.3  6e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0475498  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1137  kinase, PfkB family  30.43 
 
 		 316 aa  95.5  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231812  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  30.16 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  27.24 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  34.55 
 
 		 297 aa  92.8  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  32.73 
 
 		 318 aa  92.4  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  29.84 
 
 		 308 aa  92.8  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  29.62 
 
 		 327 aa  92.4  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  31.83 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  31.83 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  32.46 
 
 		 318 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  31.83 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  31.83 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  30.13 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  31.83 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  33.79 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  32.49 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  32.38 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  34.84 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  29.93 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  31.19 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  31.19 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  33.33 
 
 		 297 aa  89.7  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  31.19 
 
 		 314 aa  89  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  31.19 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  31.19 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  31.19 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  24.3 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  31.19 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  31.15 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  30.87 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  30.87 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  34.52 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  32.47 
 
 		 305 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  29.87 
 
 		 320 aa  85.9  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  34.09 
 
 		 309 aa  85.5  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  23.97 
 
 		 310 aa  85.9  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  30.87 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  31.05 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  31.11 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  29.21 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  31.6 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  30.16 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  30.34 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  35.19 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  30.3 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  30.57 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  26.36 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  31.29 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>