More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09800 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  100 
 
 
341 aa  692    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  60.55 
 
 
288 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  57.85 
 
 
299 aa  308  8e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  48.04 
 
 
286 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  41.88 
 
 
313 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  48.26 
 
 
272 aa  228  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  49.19 
 
 
284 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  49.19 
 
 
284 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  49.19 
 
 
284 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  45.71 
 
 
284 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  45.12 
 
 
338 aa  216  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  49.01 
 
 
294 aa  212  7e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  43.92 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  42.47 
 
 
360 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  42.61 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  39.93 
 
 
291 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1631  signal peptidase I  46.92 
 
 
288 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  41.05 
 
 
289 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  39.09 
 
 
289 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  40.69 
 
 
290 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  40.25 
 
 
434 aa  156  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  39.84 
 
 
352 aa  156  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  44.34 
 
 
269 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  39.46 
 
 
311 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  39.91 
 
 
213 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  39.01 
 
 
213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  37.05 
 
 
469 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  40.09 
 
 
304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  37.12 
 
 
279 aa  139  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  37.02 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  35.91 
 
 
298 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  33.33 
 
 
268 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  36.53 
 
 
209 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  34.89 
 
 
290 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  36.45 
 
 
284 aa  123  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  39.73 
 
 
247 aa  122  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  36.95 
 
 
209 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05490  signal peptidase I  37.56 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  36.48 
 
 
261 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  37.28 
 
 
190 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  38.05 
 
 
184 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  36.36 
 
 
190 aa  116  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  34.91 
 
 
267 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  32.91 
 
 
216 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  31.83 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  37.56 
 
 
230 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  33.33 
 
 
214 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  37.86 
 
 
267 aa  113  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  34.39 
 
 
225 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  36.53 
 
 
197 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  36 
 
 
220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  34.39 
 
 
192 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1382  signal peptidase I  37.62 
 
 
188 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813945  normal  0.891342 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  39.06 
 
 
203 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  35.85 
 
 
193 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0179  signal peptidase I  33.91 
 
 
342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  33.79 
 
 
290 aa  109  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  32.43 
 
 
187 aa  109  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  37.55 
 
 
200 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  37.55 
 
 
200 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  37.38 
 
 
215 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  33.65 
 
 
188 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  36.41 
 
 
220 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  33.92 
 
 
185 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  34.9 
 
 
254 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  34.72 
 
 
174 aa  106  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  34.36 
 
 
243 aa  106  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  34.11 
 
 
181 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  35.65 
 
 
173 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  34.87 
 
 
225 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  33.64 
 
 
193 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  34.29 
 
 
173 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  35.9 
 
 
251 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  34.26 
 
 
285 aa  102  7e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  31.17 
 
 
262 aa  102  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  36.79 
 
 
215 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  33.49 
 
 
186 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  32.68 
 
 
176 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  33.17 
 
 
189 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  34.2 
 
 
219 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  35.24 
 
 
189 aa  99  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  33.81 
 
 
173 aa  96.7  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  36.28 
 
 
199 aa  94.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  31.9 
 
 
216 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  34.27 
 
 
198 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  31.38 
 
 
220 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  36.57 
 
 
171 aa  93.6  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  32.93 
 
 
220 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  31.51 
 
 
231 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  36.98 
 
 
191 aa  92.8  7e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  31.12 
 
 
230 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  32.52 
 
 
197 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  32.46 
 
 
200 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  36.36 
 
 
170 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09200  signal peptidase I  34.58 
 
 
247 aa  89.4  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.537704  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  30.8 
 
 
216 aa  89.4  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  33.48 
 
 
217 aa  88.6  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  34.91 
 
 
208 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  30.95 
 
 
221 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  30.95 
 
 
221 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>