More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2063 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  498  1e-140  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  41.06 
 
 
269 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  41.06 
 
 
269 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  43.37 
 
 
272 aa  195  7e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  39.62 
 
 
277 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  41.64 
 
 
284 aa  193  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  43.97 
 
 
264 aa  192  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  37.27 
 
 
277 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  42.91 
 
 
269 aa  188  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  37.02 
 
 
276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  35.79 
 
 
277 aa  182  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  38.91 
 
 
300 aa  182  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  35.79 
 
 
277 aa  182  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  36.16 
 
 
277 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  37.26 
 
 
279 aa  179  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  38.52 
 
 
330 aa  178  5.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  36.53 
 
 
277 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  40.4 
 
 
274 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  36.16 
 
 
277 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  35.79 
 
 
277 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  35.79 
 
 
277 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  35.79 
 
 
277 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  40.62 
 
 
285 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  35.79 
 
 
277 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  35.79 
 
 
277 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  35.9 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  39.2 
 
 
274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  38.02 
 
 
277 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  39.23 
 
 
272 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  40.93 
 
 
277 aa  169  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  36.36 
 
 
271 aa  168  9e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  36.08 
 
 
291 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  39.33 
 
 
272 aa  166  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  35.23 
 
 
289 aa  165  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  37.12 
 
 
272 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  35.91 
 
 
270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  34.9 
 
 
291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  36.33 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  39.08 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  39.44 
 
 
339 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  37.35 
 
 
269 aa  160  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  35.88 
 
 
268 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  36.26 
 
 
268 aa  159  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  35.82 
 
 
277 aa  159  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  33.7 
 
 
268 aa  158  8e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  33.96 
 
 
264 aa  156  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  33.96 
 
 
269 aa  155  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  37.6 
 
 
270 aa  156  4e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  34.72 
 
 
285 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.95 
 
 
308 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  34.08 
 
 
269 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  35.32 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  34.36 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  34.66 
 
 
290 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  34.66 
 
 
290 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  34.13 
 
 
326 aa  149  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  34.09 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  32.84 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  36.03 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  35.58 
 
 
277 aa  145  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  37.35 
 
 
301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  34.11 
 
 
297 aa  144  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  35.06 
 
 
268 aa  143  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  33.46 
 
 
261 aa  142  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  31.78 
 
 
266 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  32.7 
 
 
267 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  32.41 
 
 
261 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  32.41 
 
 
261 aa  139  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  32.41 
 
 
261 aa  139  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  32.82 
 
 
267 aa  139  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  32.41 
 
 
261 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  32.02 
 
 
261 aa  139  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  30.8 
 
 
272 aa  138  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  32.32 
 
 
267 aa  138  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  32.41 
 
 
261 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  35.6 
 
 
269 aa  138  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  30.8 
 
 
272 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  32.02 
 
 
261 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  32.41 
 
 
261 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  32.02 
 
 
261 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  34.92 
 
 
261 aa  137  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  31.56 
 
 
267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  31.52 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  31.58 
 
 
281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  31.39 
 
 
337 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  31.13 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0965  ABC-3 protein  33.71 
 
 
357 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  unclonable  0.00000935125  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.88 
 
 
310 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  31.13 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  31.13 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  31.13 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  30.15 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0037  cation ABC transporter, permease protein  33.72 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  31.18 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  37.21 
 
 
273 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  31.68 
 
 
280 aa  132  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  29.7 
 
 
361 aa  132  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  33.46 
 
 
262 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 
268 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  34.21 
 
 
277 aa  131  9e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>