More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0664 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0664  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  479  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1693  two-component regulator  81.08 
 
 		 223 aa  374  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000232098  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0235  response regulator receiver  79.37 
 
 		 223 aa  374  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0242  two-component regulator  79.28 
 
 		 223 aa  371  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.20879  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0980  response regulator receiver domain-containing protein  80.18 
 
 		 223 aa  370  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000790444  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0745  two-component regulator  77.93 
 
 		 223 aa  368  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.802142  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0404  DNA-binding response regulator  70.72 
 
 		 223 aa  345  4e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.887957  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0379  DNA-binding response regulator  70.72 
 
 		 223 aa  345  5e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1603  DNA-binding response regulator  69.82 
 
 		 223 aa  342  2e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0175  two-component response regulator  69.2 
 
 		 224 aa  339  2e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1559  response regulator receiver  37.78 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.71 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  35 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2062  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 228 aa  149  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0133309  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.45 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1610  two component transcriptional regulator  36.53 
 
 		 232 aa  148  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.496365  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  33.04 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  38.07 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.2 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.32 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  33.78 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  35.32 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  33.92 
 
 		 283 aa  138  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2976  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3919  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.47 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3997  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.19 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.94 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  34.55 
 
 		 253 aa  136  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3856  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.39 
 
 		 224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5331  transcriptional regulator two components regulatory system  31.82 
 
 		 225 aa  134  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0274603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2880  two component transcriptional regulator  33.79 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  35.09 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0373  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.1 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1433  two component transcriptional regulator  37.73 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4842  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.05 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.649395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  34.09 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.6 
 
 		 227 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1198  two component transcriptional regulator  32.58 
 
 		 225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1233  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.94 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4240  two component transcriptional regulator  33.03 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.735778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4527  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  33.03 
 
 		 223 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0317  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4933  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  37.73 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.344735 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6111  regulator protein CopR  33.19 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110686  normal  0.158568 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49180  two-component response regulator PhoP  32.27 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000831037 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.53 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3491  two component transcriptional regulator  36.99 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2084  DNA-binding heavy metal response regulator  34.55 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000771382  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1824  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2192  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.55 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4200  two-component response regulator PhoP  32.27 
 
 		 225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  32.27 
 
 		 227 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 226 aa  128  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004385  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  34.53 
 
 		 229 aa  128  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0253  DNA-binding response regulator PhoB  34.53 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01026  response regulator  34.53 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5672  DNA-binding response regulator  33.92 
 
 		 228 aa  128  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  35.32 
 
 		 224 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2348  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 224 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000162881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.42 
 
 		 226 aa  128  9.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 222 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  31.67 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  31.19 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2480  DNA-binding heavy metal response regulator  34.55 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000187636  normal  0.518539 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  31.19 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748a  hypothetical protein  37.27 
 
 		 223 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697031  normal  0.305387 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0723  transcriptional regulator, response regulator  35.45 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3454  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.09 
 
 		 223 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.14 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.87 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3610  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.87 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  31.19 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  31.19 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0344  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.86 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  33.03 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  31.39 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1324  response regulator receiver  32.73 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000482292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00521  hypothetical protein  32.59 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  32.42 
 
 		 228 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4230  two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  34.86 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  35.11 
 
 		 225 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0589  DNA-binding transcriptional activator CusR  32.59 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.180273  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1490  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.2 
 
 		 225 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1074  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000246777  normal  0.491091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>