More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0660 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0660  surface antigen (D15)  100 
 
 		 755 aa  1518    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.665209  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0942  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  42.23 
 
 		 751 aa  581  1e-164  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000918625  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1757  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  41.24 
 
 		 759 aa  575  1.0000000000000001e-162  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000442418  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  40.92 
 
 		 739 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0164  OMP85 family outer membrane protein  40.92 
 
 		 739 aa  571  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00465042  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0215  conserved hypothetical protein, putative outer membrane protein  41.52 
 
 		 738 aa  566  1e-160  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0238562  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  41.28 
 
 		 745 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0142  OMP85 family outer membrane protein  40.26 
 
 		 739 aa  558  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0561822  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1501  OMP85 family outer membrane protein  38.05 
 
 		 757 aa  535  1e-150  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.68 
 
 		 749 aa  520  1e-146  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.96 
 
 		 808 aa  318  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.24 
 
 		 802 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.24 
 
 		 895 aa  300  9e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  28.94 
 
 		 752 aa  299  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  27.76 
 
 		 765 aa  294  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  29.32 
 
 		 769 aa  293  9e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  28.94 
 
 		 763 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.61 
 
 		 752 aa  289  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.88 
 
 		 892 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  27.89 
 
 		 751 aa  282  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.84 
 
 		 895 aa  261  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  26.34 
 
 		 788 aa  253  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  27.5 
 
 		 763 aa  251  3e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  25.71 
 
 		 790 aa  251  5e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.97 
 
 		 800 aa  249  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.95 
 
 		 784 aa  246  8e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.01 
 
 		 761 aa  246  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  26.9 
 
 		 770 aa  246  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  26.27 
 
 		 913 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0718  OMP85 family outer membrane protein  26.74 
 
 		 744 aa  244  3e-63  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  25.82 
 
 		 784 aa  244  3.9999999999999997e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.3 
 
 		 781 aa  244  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.97 
 
 		 769 aa  244  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.6 
 
 		 769 aa  243  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  26.35 
 
 		 785 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.45 
 
 		 787 aa  243  9e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.74 
 
 		 770 aa  242  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.03 
 
 		 765 aa  242  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.92 
 
 		 770 aa  241  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  26.08 
 
 		 768 aa  241  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.95 
 
 		 768 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  25.52 
 
 		 768 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.87 
 
 		 785 aa  239  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  25.1 
 
 		 758 aa  239  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  26.08 
 
 		 769 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  26.08 
 
 		 769 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.71 
 
 		 769 aa  239  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  25.52 
 
 		 768 aa  238  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.02 
 
 		 750 aa  238  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  25.52 
 
 		 769 aa  238  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  25.52 
 
 		 768 aa  238  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  25.52 
 
 		 768 aa  238  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  25.39 
 
 		 768 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  25.39 
 
 		 769 aa  237  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  25.65 
 
 		 767 aa  237  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  25.39 
 
 		 769 aa  237  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.82 
 
 		 769 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  25.83 
 
 		 765 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  25.82 
 
 		 769 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  25.51 
 
 		 781 aa  233  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  26.89 
 
 		 888 aa  233  7.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  24.33 
 
 		 820 aa  233  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  24.45 
 
 		 790 aa  232  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.03 
 
 		 784 aa  232  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.03 
 
 		 765 aa  231  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.43 
 
 		 793 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.97 
 
 		 848 aa  227  7e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  26 
 
 		 893 aa  226  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.2 
 
 		 793 aa  225  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  24.97 
 
 		 765 aa  225  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2607  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.7 
 
 		 811 aa  224  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.745531  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  24.9 
 
 		 806 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.5 
 
 		 765 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  25.42 
 
 		 779 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  24.5 
 
 		 765 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  24.42 
 
 		 785 aa  221  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  24.1 
 
 		 767 aa  221  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  25.62 
 
 		 791 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.98 
 
 		 920 aa  221  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.71 
 
 		 784 aa  220  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  26.01 
 
 		 760 aa  219  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  24.58 
 
 		 777 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  24.66 
 
 		 792 aa  218  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1855  surface antigen (D15)  25.95 
 
 		 799 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  25.1 
 
 		 784 aa  218  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  27.37 
 
 		 896 aa  218  5e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  24.54 
 
 		 765 aa  217  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.95 
 
 		 804 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  24.58 
 
 		 818 aa  215  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  25.55 
 
 		 772 aa  214  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  23.87 
 
 		 781 aa  214  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.87 
 
 		 781 aa  214  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  24.28 
 
 		 795 aa  213  9e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.07 
 
 		 758 aa  213  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.28 
 
 		 800 aa  212  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  24.52 
 
 		 787 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  24.7 
 
 		 778 aa  211  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  24.36 
 
 		 766 aa  210  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  24.27 
 
 		 787 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.74 
 
 		 799 aa  210  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>