131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3655 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  89.55 
 
 		 222 aa  371  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  42.94 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  42.78 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  39.59 
 
 		 239 aa  136  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  45.18 
 
 		 208 aa  132  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  41.42 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  40.4 
 
 		 217 aa  125  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  40.35 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  39.69 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  37.79 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  35.23 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  37.08 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  38.95 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  34.33 
 
 		 271 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  35.68 
 
 		 280 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  32.84 
 
 		 270 aa  98.6  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  36.14 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  29.2 
 
 		 248 aa  94.7  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  34.24 
 
 		 264 aa  94.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  35.85 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  32.74 
 
 		 202 aa  88.2  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  31.06 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  32.16 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  29.83 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  34.91 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  29.45 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  31.48 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  27.35 
 
 		 300 aa  78.6  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  31.12 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  34.16 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  30.97 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  32.03 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  32.03 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  32.03 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  29.21 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  33.53 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  27.69 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  27.69 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  33.76 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  30.97 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  33.55 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  27.33 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  26.83 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  29.48 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  31.54 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  30.91 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0869  protein of unknown function DUF305  28.35 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296281  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  28.97 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  33.06 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  26.42 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4915  hypothetical protein  25.12 
 
 		 370 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  30.25 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  30.32 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  32.92 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1186  protein of unknown function DUF305  26.97 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220752  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  30.99 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  30.99 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  29.63 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  30.17 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  31.21 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  31.21 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  31.21 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  26.67 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  29.31 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  29.61 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  30.49 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  31.45 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  29.61 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  28.07 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  26.71 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  27.98 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  25.15 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  27.88 
 
 		 279 aa  62  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  30 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  27.54 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  26.88 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  30.59 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  28.49 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  30.59 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  26.71 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  30.59 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  34.04 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  26.99 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1820  hypothetical protein  28.75 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.241651 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  30.13 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  23.87 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  26.49 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  29.61 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  27.14 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  26.74 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  26.74 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  31.01 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  26.22 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  27.22 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  26.63 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  35.59 
 
 		 122 aa  52.4  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  25.3 
 
 		 226 aa  52  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  26.8 
 
 		 263 aa  51.6  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  28.1 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>