84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2246 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  100 
 
 
361 aa  717    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  31.78 
 
 
291 aa  89.7  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  26.6 
 
 
519 aa  86.7  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  26.64 
 
 
691 aa  86.7  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  32.46 
 
 
534 aa  83.6  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  28.02 
 
 
530 aa  80.9  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  26.67 
 
 
769 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  24.66 
 
 
770 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  24.66 
 
 
770 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  23.55 
 
 
327 aa  79  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  25.91 
 
 
770 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  22.73 
 
 
449 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  25 
 
 
769 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  26.83 
 
 
454 aa  77  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  25.85 
 
 
769 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  25.42 
 
 
770 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  25.44 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  25.84 
 
 
621 aa  72.8  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  24.39 
 
 
770 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  24.39 
 
 
770 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  29.23 
 
 
720 aa  70.5  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  29.23 
 
 
720 aa  69.3  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  31.5 
 
 
188 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  28.87 
 
 
720 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  22.14 
 
 
768 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  21.57 
 
 
772 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  24.86 
 
 
240 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  23.08 
 
 
838 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  27.16 
 
 
300 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  28.24 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  22.92 
 
 
838 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  22.92 
 
 
838 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  24.56 
 
 
722 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  26.18 
 
 
332 aa  63.2  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  24.26 
 
 
722 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  25.32 
 
 
746 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  29.32 
 
 
577 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  24.56 
 
 
722 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  26.45 
 
 
757 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  24.56 
 
 
722 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  25 
 
 
759 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  22.74 
 
 
836 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  32.77 
 
 
171 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  25.97 
 
 
755 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0961  MORN repeat-containing protein  22.49 
 
 
576 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3382  MORN repeat-containing protein  22.15 
 
 
576 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  29.32 
 
 
577 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  29.32 
 
 
577 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  26.32 
 
 
181 aa  59.7  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  24.03 
 
 
755 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0981  MORN variant repeat protein  25.65 
 
 
576 aa  59.3  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  29.13 
 
 
577 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  28.26 
 
 
274 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  32.23 
 
 
203 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4372  hypothetical protein  25.71 
 
 
173 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  23.33 
 
 
238 aa  57  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  28.21 
 
 
226 aa  56.6  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4239  hypothetical protein  26.43 
 
 
175 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4395  hypothetical protein  26.73 
 
 
175 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  24.11 
 
 
566 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  22.66 
 
 
571 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  22.46 
 
 
566 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  22.12 
 
 
566 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  25.5 
 
 
602 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  23.51 
 
 
580 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0761  hypothetical protein  24.85 
 
 
823 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.132602  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0819  MORN repeat-containing protein  28.07 
 
 
159 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00975  hypothetical protein  36.04 
 
 
230 aa  50.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189504  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  22.11 
 
 
566 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  25.81 
 
 
178 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2385  hypothetical protein  30.56 
 
 
239 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  25.81 
 
 
178 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  23.33 
 
 
180 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1446  hypothetical protein  26.62 
 
 
231 aa  49.3  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  23.35 
 
 
566 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5689  hypothetical protein  30.88 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2460  hypothetical protein  23.02 
 
 
347 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000292173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1044  hypothetical protein  25.86 
 
 
352 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  23.78 
 
 
566 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1361  MORN variant repeat protein  28.8 
 
 
221 aa  46.6  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000616992  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  23.92 
 
 
566 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  23.17 
 
 
566 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  23.23 
 
 
580 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1603  PDZ/DHR/GLGF domain protein  23.96 
 
 
590 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150565  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>