54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1786 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  100 
 
 		 233 aa  465  9.999999999999999e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  54.31 
 
 		 230 aa  254  1.0000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  37.21 
 
 		 938 aa  136  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.78 
 
 		 756 aa  134  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  34.53 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  39.68 
 
 		 808 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  36.28 
 
 		 769 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  38.95 
 
 		 751 aa  118  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  37.63 
 
 		 749 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  37.63 
 
 		 749 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  36.13 
 
 		 776 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1706  ERCC4 domain-containing protein  37.57 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  33.17 
 
 		 763 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  34.27 
 
 		 751 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  34.11 
 
 		 750 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  32.41 
 
 		 745 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5061  ERCC4  31.73 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  33.03 
 
 		 820 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  33.85 
 
 		 836 aa  99.8  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2438  ERCC4 domain-containing protein  30.2 
 
 		 234 aa  99  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41003  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  30.99 
 
 		 754 aa  98.6  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0296  helicase-associated endonuclease for fork-structured DNA  28.84 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942206 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  32.31 
 
 		 851 aa  98.2  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  32.57 
 
 		 829 aa  95.9  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  32.24 
 
 		 212 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  28.57 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  29.49 
 
 		 833 aa  91.7  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  30.95 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  30.95 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  32.71 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0629  ERCC4 domain-containing protein  33.87 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0726  ERCC4 domain-containing protein  32 
 
 		 219 aa  89.4  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  27.75 
 
 		 749 aa  87.8  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  31.75 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1707  ERCC4 domain-containing protein  31.67 
 
 		 215 aa  85.5  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0341786 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0400  ERCC4 domain protein  30.67 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60166  predicted protein  44.58 
 
 		 564 aa  73.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000965923 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1024  ERCC4 domain protein  27.91 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0772  ERCC4 domain-containing protein  31.75 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08713  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  40.24 
 
 		 985 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0291  ERCC4  32.79 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.148147  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42450  predicted protein  22.61 
 
 		 975 aa  69.3  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.488375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2814  ERCC4 domain protein  23.92 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01820  conserved hypothetical protein  40 
 
 		 1099 aa  57.8  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30908  excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 4  23.15 
 
 		 975 aa  55.5  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2758  ERCC4 domain protein  27.19 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.863848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4379  ERCC4  29.77 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0905  hypothetical protein  25.79 
 
 		 158 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0333285  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0815  excinuclease ABC, C subunit  30.23 
 
 		 780 aa  44.7  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  35.71 
 
 		 591 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3788  ERCC4 domain-containing protein  27.5 
 
 		 160 aa  42.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1923  hypothetical protein  27.5 
 
 		 160 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00139334  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  45.28 
 
 		 608 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  45.28 
 
 		 608 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>