117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0391 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0391  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
255 aa  511  1e-144  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494211  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0832  AsnC family transcriptional regulator  55.91 
 
 
255 aa  296  2e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0797  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 
265 aa  181  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95017  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0364  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.32 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  45.9 
 
 
156 aa  52.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.87 
 
 
153 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.26 
 
 
153 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.26 
 
 
153 aa  51.2  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.26 
 
 
153 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  38.46 
 
 
153 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1225  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 
143 aa  49.3  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  38.33 
 
 
162 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  38.33 
 
 
162 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  38.33 
 
 
162 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2729  transcriptional regulator, AsnC family  41.07 
 
 
137 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134973  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1715  AsnC family transcriptional regulator  26 
 
 
300 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.128343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.16 
 
 
153 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.16 
 
 
164 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.16 
 
 
164 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.16 
 
 
164 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4759  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 
154 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.26 
 
 
164 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  41.67 
 
 
154 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2326  transcriptional regulator, AsnC family  31.3 
 
 
137 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.572639 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0418  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
137 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.550786  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  38.33 
 
 
162 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3829  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 
154 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  38.98 
 
 
157 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  29 
 
 
149 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.36 
 
 
153 aa  46.6  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.16 
 
 
153 aa  46.2  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.16 
 
 
153 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.78 
 
 
153 aa  45.8  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
156 aa  45.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40 
 
 
154 aa  45.8  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  44.44 
 
 
156 aa  45.8  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  38.33 
 
 
153 aa  45.8  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.16 
 
 
153 aa  45.8  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2693  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.68 
 
 
196 aa  45.4  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0495669 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  38.33 
 
 
161 aa  45.4  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.16 
 
 
153 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2719  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
149 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519485  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  36.07 
 
 
156 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.71 
 
 
150 aa  45.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1377  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
149 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370813  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.16 
 
 
164 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.61 
 
 
153 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 
156 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.16 
 
 
164 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.16 
 
 
164 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 
150 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  39.34 
 
 
160 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  30.7 
 
 
291 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 
145 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 
150 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
140 aa  45.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
167 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7861  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.18 
 
 
150 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0789573  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  37.7 
 
 
192 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0907  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.68 
 
 
199 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.52 
 
 
152 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8199  response regulator receiver and unknown domain protein  32.56 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
156 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  38.6 
 
 
137 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.52 
 
 
152 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  31.52 
 
 
152 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  31.71 
 
 
152 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2472  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
163 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  42.31 
 
 
137 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
163 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  20.1 
 
 
299 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  38.33 
 
 
157 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  31.71 
 
 
152 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  31.71 
 
 
152 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.52 
 
 
152 aa  43.5  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.52 
 
 
152 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  37.29 
 
 
148 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.52 
 
 
152 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
163 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.52 
 
 
152 aa  43.5  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  38.33 
 
 
153 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.52 
 
 
152 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  40.68 
 
 
153 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  31.52 
 
 
152 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  38.33 
 
 
153 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  37.7 
 
 
203 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
146 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.16 
 
 
153 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  37.31 
 
 
144 aa  43.5  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
153 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0144  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.45 
 
 
204 aa  43.5  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  38.33 
 
 
154 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  34.92 
 
 
156 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
163 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
158 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  37.74 
 
 
162 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  40.98 
 
 
153 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
155 aa  42.7  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.43 
 
 
152 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.43 
 
 
152 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>