158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2405 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  100 
 
 		 365 aa  759    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  90.68 
 
 		 368 aa  695    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1189  peptidyl-arginine deiminase  71.23 
 
 		 373 aa  558  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1849  agmatine deiminase  70.77 
 
 		 369 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552976  decreased coverage  0.00228426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2154  peptidyl-arginine deiminase  70.22 
 
 		 371 aa  551  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  54.95 
 
 		 369 aa  424  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  54.49 
 
 		 370 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  56.67 
 
 		 374 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  55.56 
 
 		 368 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  52.89 
 
 		 368 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  52.89 
 
 		 368 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  52.89 
 
 		 368 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  53.42 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  51.93 
 
 		 364 aa  392  1e-108  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  54.72 
 
 		 368 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  51.1 
 
 		 368 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  50.27 
 
 		 368 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  49.73 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  49.73 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  52.89 
 
 		 368 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  51.25 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2192  agmatine deiminase  50.41 
 
 		 373 aa  370  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  48.9 
 
 		 371 aa  361  9e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  47.37 
 
 		 370 aa  359  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  48.59 
 
 		 367 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  46.91 
 
 		 370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  47.37 
 
 		 370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  48.59 
 
 		 367 aa  355  5e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  47.47 
 
 		 370 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  47.47 
 
 		 370 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  47.19 
 
 		 370 aa  354  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  47.19 
 
 		 370 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  47.9 
 
 		 375 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  46.63 
 
 		 370 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  46.35 
 
 		 370 aa  349  6e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  48.88 
 
 		 365 aa  345  8.999999999999999e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  46.63 
 
 		 370 aa  344  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  48.03 
 
 		 365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  46.39 
 
 		 369 aa  339  5e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  45.81 
 
 		 371 aa  336  2.9999999999999997e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  45.81 
 
 		 371 aa  336  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  45.81 
 
 		 365 aa  336  3.9999999999999995e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0678  agmatine deiminase  43.92 
 
 		 386 aa  316  5e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.421408 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  44.54 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  36.01 
 
 		 347 aa  256  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  36.01 
 
 		 346 aa  255  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  37.71 
 
 		 346 aa  242  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  35.65 
 
 		 342 aa  239  8e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  37.09 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  35.97 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  35.44 
 
 		 348 aa  229  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36398  predicted protein  35.22 
 
 		 386 aa  226  6e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  35.36 
 
 		 347 aa  225  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  34.32 
 
 		 358 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  32.42 
 
 		 350 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  35.16 
 
 		 624 aa  212  9e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  33.15 
 
 		 349 aa  209  8e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  37.85 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  33.33 
 
 		 348 aa  206  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  31.92 
 
 		 339 aa  205  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  32.32 
 
 		 346 aa  205  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  33.79 
 
 		 639 aa  205  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  33.15 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  33.51 
 
 		 347 aa  203  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  31.53 
 
 		 334 aa  202  7e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  34.41 
 
 		 640 aa  202  9e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  33.15 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  34.84 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  32.04 
 
 		 349 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  32.87 
 
 		 346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  32.77 
 
 		 334 aa  198  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  31.96 
 
 		 631 aa  196  7e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  33.15 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  33.62 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  31.67 
 
 		 348 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  32.11 
 
 		 375 aa  194  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  32.69 
 
 		 351 aa  192  9e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6169  Agmatine deiminase  33.99 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  32.05 
 
 		 353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  33.15 
 
 		 343 aa  190  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  30.11 
 
 		 348 aa  190  4e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  31.79 
 
 		 349 aa  189  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  32.14 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0833  Agmatine deiminase  32.68 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  31.42 
 
 		 349 aa  182  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  32.48 
 
 		 374 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0759  peptidyl-arginine deiminase  33.15 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.451964  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  34.54 
 
 		 346 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  30.71 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1048  agmatine deiminase  31.39 
 
 		 368 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.649771  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  31.13 
 
 		 365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4626  agmatine deiminase  30.55 
 
 		 369 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  33.24 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  29.06 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4697  agmatine deiminase  32.09 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.399563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  32.02 
 
 		 351 aa  159  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  29.89 
 
 		 344 aa  159  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2482  agmatine deiminase  29.04 
 
 		 375 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  30.71 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2561  Agmatine deiminase  29.2 
 
 		 377 aa  157  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>