47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1337 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  480  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  53.51 
 
 		 243 aa  244  6.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  50.88 
 
 		 234 aa  239  4e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  55.22 
 
 		 257 aa  232  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  49.57 
 
 		 236 aa  220  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  52.4 
 
 		 236 aa  218  7e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  46.38 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  44.92 
 
 		 243 aa  208  5e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  49.35 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  46.54 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  43.36 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  48.42 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  44.34 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  44.71 
 
 		 238 aa  188  8e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  46.12 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  42.45 
 
 		 550 aa  178  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  41.3 
 
 		 237 aa  168  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  42.11 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  42.52 
 
 		 243 aa  158  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  35.78 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  27.93 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  29.49 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  27.35 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  26.14 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  30.09 
 
 		 224 aa  85.1  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  27.78 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  27.12 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  29.28 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  22.83 
 
 		 250 aa  72  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  27.31 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  25.44 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  25.22 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  26.67 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  25.32 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  28.72 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  34.09 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  26.2 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  34.09 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  34.09 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  23.64 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  27.63 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  25 
 
 		 225 aa  48.5  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3013  DNA-7-methylguanine glycosylase  30 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  26.34 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6988  DNA alkylation repair enzyme  26.87 
 
 		 233 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  24.62 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2310  hypothetical protein  27.86 
 
 		 227 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>