More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9143 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  72.61 
 
 		 475 aa  683    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 466 aa  922    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4466  DNA repair protein RadA  62.88 
 
 		 468 aa  555  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  65.5 
 
 		 462 aa  546  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  64.94 
 
 		 454 aa  530  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  64.34 
 
 		 472 aa  525  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  56.16 
 
 		 453 aa  507  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  59.61 
 
 		 457 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  63.18 
 
 		 473 aa  506  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35070  DNA repair protein RadA  65.11 
 
 		 454 aa  504  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.773163 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  64.61 
 
 		 457 aa  503  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  65.87 
 
 		 483 aa  502  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  62.68 
 
 		 473 aa  496  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3279  DNA repair protein RadA  61.05 
 
 		 478 aa  493  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  hitchhiker  0.00533763 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01590  DNA repair protein RadA  59.44 
 
 		 478 aa  494  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24550  DNA repair protein RadA  61.23 
 
 		 461 aa  489  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8361  DNA repair protein RadA  60.94 
 
 		 468 aa  488  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4258  DNA repair protein RadA  60.86 
 
 		 485 aa  483  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0366  DNA repair protein RadA  61.8 
 
 		 462 aa  478  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0397  DNA repair protein RadA  59.27 
 
 		 498 aa  478  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0645  DNA repair protein RadA  59.73 
 
 		 449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  53.16 
 
 		 467 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  53.38 
 
 		 462 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0359  DNA repair protein RadA  61.19 
 
 		 490 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  hitchhiker  0.00589399 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4269  DNA repair protein RadA  60.19 
 
 		 481 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4699  DNA repair protein RadA  60.52 
 
 		 499 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0228  DNA repair protein RadA  58.87 
 
 		 460 aa  443  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.745621 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5128  DNA repair protein RadA  53.16 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.764257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4828  DNA repair protein RadA  52.95 
 
 		 466 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0968  DNA repair protein RadA  53.74 
 
 		 461 aa  441  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000135308  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4742  DNA repair protein RadA  52.95 
 
 		 466 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0599  DNA repair protein RadA  56.51 
 
 		 461 aa  433  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.316853  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0150  DNA repair protein RadA  55.88 
 
 		 465 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627247  normal  0.549694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0864  DNA repair protein RadA  54.77 
 
 		 475 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.493178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13618  DNA repair protein RadA  54.78 
 
 		 480 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516493 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  44.68 
 
 		 454 aa  403  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  46.77 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0293  DNA repair protein RadA  44.99 
 
 		 495 aa  400  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  46.88 
 
 		 457 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  45.51 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 462 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  44.86 
 
 		 457 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  45.05 
 
 		 454 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  45.05 
 
 		 454 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  47.89 
 
 		 450 aa  398  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  44.61 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  46.62 
 
 		 484 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  44.86 
 
 		 457 aa  389  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1747  DNA repair protein RadA  48.34 
 
 		 512 aa  391  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  50.93 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5347  DNA repair protein RadA  51.16 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0917  DNA repair protein RadA  51.9 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  43.12 
 
 		 454 aa  391  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  49.3 
 
 		 453 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  45.41 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  45 
 
 		 448 aa  385  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2057  DNA repair protein RadA  50.7 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  44.99 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2038  DNA repair protein RadA  50.7 
 
 		 458 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  47.38 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1939  DNA repair protein RadA  50.7 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763295 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  44.52 
 
 		 458 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2008  DNA repair protein RadA  50.81 
 
 		 458 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480875  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1239  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.873439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  50.59 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6039  DNA repair protein RadA  50.47 
 
 		 458 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667951  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2070  DNA repair protein RadA  50.7 
 
 		 458 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  42.4 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  47.02 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  45.35 
 
 		 452 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  45.5 
 
 		 451 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0731  DNA repair protein RadA  47.45 
 
 		 463 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  46.78 
 
 		 462 aa  381  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  44.29 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  44.29 
 
 		 458 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  44.06 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3235  DNA repair protein RadA  50.58 
 
 		 458 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  46.78 
 
 		 462 aa  382  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  44.06 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  44.29 
 
 		 458 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1574  DNA repair protein RadA  50.58 
 
 		 458 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0646  DNA repair protein RadA  47.45 
 
 		 463 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2602  DNA repair protein RadA  50.23 
 
 		 458 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0200982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  47.55 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0926  DNA repair protein RadA  47.6 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  41.33 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  44.06 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  44.29 
 
 		 458 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3556  DNA repair protein RadA  50.12 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1349  DNA repair protein RadA  50.58 
 
 		 458 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2513  DNA repair protein RadA  50.58 
 
 		 458 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167746  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  44.29 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  49.18 
 
 		 451 aa  381  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2077  DNA repair protein RadA  50.58 
 
 		 458 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0646051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  44.29 
 
 		 458 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  46.1 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2457  DNA repair protein RadA  50.58 
 
 		 458 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4932  DNA repair protein RadA  45.86 
 
 		 457 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  41.23 
 
 		 457 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>