More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5886 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5886  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 187 aa  363  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  46.11 
 
 		 184 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4753  phosphoglycerate mutase  49.17 
 
 		 183 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.26299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4839  phosphoglycerate mutase  49.17 
 
 		 183 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  42.22 
 
 		 184 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5139  phosphoglycerate mutase  49.17 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2060  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  48.31 
 
 		 189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  46.49 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  44.74 
 
 		 197 aa  140  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  44.5 
 
 		 198 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1433  phosphoglycerate mutase  47.54 
 
 		 183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781386  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  43.58 
 
 		 196 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  43.58 
 
 		 196 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  43.26 
 
 		 195 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  42.55 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  43.78 
 
 		 195 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1874  phosphoglycerate mutase  41.44 
 
 		 179 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.760492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1721  phosphoglycerate mutase  43.02 
 
 		 179 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3495  phosphoglycerate mutase  45.3 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2243  phosphoglycerate mutase  41.99 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580573  normal  0.494376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3438  phosphoglycerate mutase  48.13 
 
 		 191 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  43.15 
 
 		 237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2505  phosphoglycerate mutase  44.89 
 
 		 191 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0529563 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  43.24 
 
 		 195 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 370 aa  82.4  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.07 
 
 		 427 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.1 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  37.79 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.37 
 
 		 378 aa  68.2  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  41.18 
 
 		 391 aa  68.2  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.96 
 
 		 369 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 		 253 aa  64.3  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  33.87 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1805  Phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.622206  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  25.85 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  33.52 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.59 
 
 		 382 aa  62.4  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  26.83 
 
 		 448 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  37.89 
 
 		 452 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  33.51 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  34.05 
 
 		 366 aa  61.2  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 235 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  31.87 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  32.64 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  37.72 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32.85 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  38.4 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.04 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  24.71 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1654  putative phosphoglycerate mutase  34.4 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  33.81 
 
 		 227 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.27 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  33.87 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  39.32 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  29.83 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  32.02 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  24.32 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  24.32 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  34.11 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.24 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.22 
 
 		 356 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 		 412 aa  54.7  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  32.6 
 
 		 241 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  36.09 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  37.59 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  34.44 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  26.29 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.01 
 
 		 442 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 412 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.99 
 
 		 442 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>