More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5223 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5223  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  371  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846379 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2217  transcriptional regulator, TetR family  50.64 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2619  transcriptional regulator, TetR family  49.68 
 
 		 192 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6717  transcriptional regulator, TetR family  44.51 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.477187  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 		 189 aa  131  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3565  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0847285  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5045  transcriptional regulator, TetR family  43.89 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2081  transcriptional regulator, TetR family  43.39 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.586313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  43.72 
 
 		 194 aa  121  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7126  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 192 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2354  transcriptional regulator, TetR family  43.82 
 
 		 184 aa  114  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4234  transcriptional regulator, TetR family  43.51 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0811126  normal  0.324857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5046  putative transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4046  TetR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0577421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0718  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 211 aa  88.6  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  44.86 
 
 		 264 aa  87  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3888  transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 209 aa  70.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  43 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  42 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 210 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 210 aa  67.8  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  61.82 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  41 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  41.67 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  40.82 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  39.05 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  34.42 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  28.66 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  49.09 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 263 aa  54.3  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 242 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>