More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4948 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4948  response regulator receiver protein  100 
 
 		 172 aa  341  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.35356  normal  0.196222 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  63.95 
 
 		 412 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  73.97 
 
 		 206 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  59.77 
 
 		 387 aa  94  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0174  histidine kinase  56.04 
 
 		 432 aa  90.9  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  74.24 
 
 		 431 aa  90.9  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  56.25 
 
 		 412 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.15 
 
 		 222 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  45.83 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  56 
 
 		 211 aa  80.9  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  55.41 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.33 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.97 
 
 		 209 aa  77.8  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.54 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.42 
 
 		 468 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  56.58 
 
 		 214 aa  74.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.71 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  48.68 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4386  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.15 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.43 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.33 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18530  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  55.93 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  40.56 
 
 		 970 aa  68.2  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.02 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2881  response regulator receiver  45.21 
 
 		 220 aa  67.8  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00126066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.9 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.3 
 
 		 213 aa  67.8  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 209 aa  67  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  48.61 
 
 		 219 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.91 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  51.43 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  55.74 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.253855  normal  0.0592312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  48.33 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  50.7 
 
 		 234 aa  64.7  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4147  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  48.61 
 
 		 967 aa  64.7  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 224 aa  64.3  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  46.25 
 
 		 220 aa  64.3  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  54.69 
 
 		 422 aa  64.3  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.95 
 
 		 211 aa  64.3  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.82 
 
 		 224 aa  63.9  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 209 aa  63.9  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  53.12 
 
 		 541 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002362  DNA-binding HTH domain-containing protein  36.67 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0501055  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.07 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.97 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.03 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  51.61 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  49.23 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.84 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0730  two component LuxR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1030  regulatory protein, LuxR  42.86 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06533  hypothetical protein  37.5 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 238 aa  62  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 231 aa  62  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 227 aa  62  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 250 aa  62  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 237 aa  62  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.97 
 
 		 221 aa  62  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0487  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.54 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4163  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.16 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296115  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.25 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4449  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 253 aa  61.2  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03706  hypothetical protein  35.96 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6539  two component transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  45 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 781 aa  61.2  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  43.75 
 
 		 218 aa  60.8  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 213 aa  60.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0642  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.56 
 
 		 208 aa  60.8  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10861  nitrate/nitrite response transcriptional regulatory protein narL  42.86 
 
 		 216 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000061441 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  44.71 
 
 		 911 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.7 
 
 		 889 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.46 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0703  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.901141  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  36.54 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.58 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  47.76 
 
 		 993 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3277  transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0377  transcriptional regulator, LuxR family  48.48 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3766  response regulator receiver protein  44.78 
 
 		 539 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484632  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  48.39 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0644  response regulator receiver domain protein  50.82 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.520039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>