59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3404 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  100 
 
 		 290 aa  571  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  70.61 
 
 		 328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  62.21 
 
 		 281 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  52.78 
 
 		 278 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  55.56 
 
 		 268 aa  256  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  50.4 
 
 		 261 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  47.66 
 
 		 261 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  51.72 
 
 		 274 aa  238  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  55.21 
 
 		 269 aa  237  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  48.02 
 
 		 258 aa  228  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  46.37 
 
 		 262 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  45.28 
 
 		 278 aa  223  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  48.28 
 
 		 272 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  54.39 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  50.55 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  43.68 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  44.27 
 
 		 295 aa  206  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  45.96 
 
 		 271 aa  205  9e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  47.08 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  46.3 
 
 		 280 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  37.05 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  44.88 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  48.71 
 
 		 277 aa  202  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  45.91 
 
 		 280 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  42.05 
 
 		 288 aa  199  7e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  42.79 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  34.4 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  32.4 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  35.29 
 
 		 415 aa  148  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  32.8 
 
 		 276 aa  147  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  30.38 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  32.81 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  32.24 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  37.4 
 
 		 718 aa  136  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  28.67 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  30.8 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  29.5 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  31.52 
 
 		 284 aa  128  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  38.02 
 
 		 469 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  30.23 
 
 		 304 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  36.4 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  28.84 
 
 		 1701 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  28.73 
 
 		 938 aa  96.7  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  25.99 
 
 		 1546 aa  75.5  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  24.54 
 
 		 1742 aa  68.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  25.93 
 
 		 1012 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  23.58 
 
 		 2028 aa  64.7  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01168  Calcium channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1E9]  24.03 
 
 		 2110 aa  59.7  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  27.78 
 
 		 294 aa  52.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51869  calcium channel protein  20.45 
 
 		 2206 aa  48.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.56529 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  28.57 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  25.35 
 
 		 305 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  21.02 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  23.73 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  24.61 
 
 		 311 aa  46.2  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15329  predicted protein  24.35 
 
 		 533 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  27.53 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  22.03 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  25.56 
 
 		 272 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>