More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1908 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  407  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  51.71 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  53.19 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  51.06 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  45.45 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2608  conserved protein DedA family  48.12 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3102  conserved protein DedA family  42.93 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  39.15 
 
 		 200 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  39.15 
 
 		 200 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  39.15 
 
 		 200 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13040  uncharacterized membrane-associated protein  39.2 
 
 		 267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0449285  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1144  hypothetical protein  39.88 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.44715  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1143  DedA family protein  38.37 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37825  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1216  SNARE associated Golgi protein  38.95 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128142 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0665  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.36 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0621  putative membrane-associated protein  43.06 
 
 		 238 aa  101  9e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1217  SNARE associated Golgi protein  34.48 
 
 		 242 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759752 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29320  uncharacterized membrane-associated protein  39.79 
 
 		 240 aa  88.6  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  31.06 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04950  uncharacterized membrane-associated protein  36.09 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  28.92 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  27.78 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0340  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.89 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  30.86 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  30.82 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  30.82 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4801  SNARE associated Golgi protein  30.81 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  30.82 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  32.22 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0212  putative membrane-associated protein  37.91 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2277  membrane-associated protein-like protein  31.1 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  27.78 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  27.41 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0484  hypothetical protein  24.43 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.849747  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  26.98 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.98 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  26.98 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  26.98 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  27.27 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  26.77 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  26.98 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  27.27 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  27.27 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  28.11 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  26.98 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  29.63 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.43 
 
 		 240 aa  62  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.33 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  31.03 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  34.17 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  26.98 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  24.29 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  30.54 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  32.8 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  26.98 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  32.8 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  32.8 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.29 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  30.37 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  25.93 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  24.21 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  29.91 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  28.37 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  25.93 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  31.82 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0616  DedA family protein  29.84 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  29.79 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  29.8 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  27.75 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  26.88 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  25.26 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  28.12 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  27.78 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  27.37 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  27.62 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  29.1 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  32.32 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  32.32 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  32.32 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  32.32 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  32.32 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  25.79 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2475  SNARE associated Golgi protein  33.85 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  32.32 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  28.57 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  24.64 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  31.31 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  31.85 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  29.71 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  29.71 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  30.11 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1626  SNARE associated Golgi protein  25.26 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  31.54 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  27.98 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0676  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.37 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.285767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  25.87 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  28.07 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  27.86 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1854  SNARE associated Golgi protein  31.55 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.392852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>