More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3904 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3904  amidase  100 
 
 		 449 aa  905    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  65.25 
 
 		 447 aa  584  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  54.02 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  52.66 
 
 		 449 aa  404  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  50.35 
 
 		 449 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  53.12 
 
 		 449 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  49.89 
 
 		 463 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  51.63 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  49.55 
 
 		 449 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  52.55 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  52.22 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  48.88 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  48.72 
 
 		 450 aa  375  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  50.35 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  51.83 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  50.5 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0715  amidase  50.22 
 
 		 462 aa  356  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  49.08 
 
 		 451 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  50.46 
 
 		 458 aa  352  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0543  amidase  50.23 
 
 		 458 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1022  amidase  50.23 
 
 		 458 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86906  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  48.21 
 
 		 440 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0975  amidase  50.57 
 
 		 458 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0457  amidase  50.57 
 
 		 458 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2972  amidase  50.57 
 
 		 616 aa  346  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2912  amidase  50.57 
 
 		 472 aa  345  7e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3019  amidase  50.57 
 
 		 472 aa  345  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  50.46 
 
 		 458 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0172  amidase  50.57 
 
 		 616 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2603  amidase  50.57 
 
 		 616 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385736  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1615  amidase  50.69 
 
 		 476 aa  344  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0898  amidase  50.69 
 
 		 458 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  47.85 
 
 		 452 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  47.17 
 
 		 441 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  48.28 
 
 		 453 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0981  amidase  50 
 
 		 458 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4134  amidase  50 
 
 		 458 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  49.36 
 
 		 453 aa  330  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  45.77 
 
 		 448 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  47.55 
 
 		 469 aa  323  5e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  46.06 
 
 		 413 aa  322  7e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3039  amidase  49.33 
 
 		 459 aa  322  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0144901 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  48.21 
 
 		 457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  45.89 
 
 		 457 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  47.71 
 
 		 448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  47.47 
 
 		 448 aa  306  7e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0952  amidase  49.44 
 
 		 481 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  43.15 
 
 		 459 aa  299  6e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  44.75 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  40.98 
 
 		 456 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  43.34 
 
 		 456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  40.18 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  41.53 
 
 		 423 aa  249  7e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  40.96 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  44.13 
 
 		 451 aa  243  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2984  amidase  44.17 
 
 		 435 aa  243  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  40.42 
 
 		 446 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  40.42 
 
 		 446 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  40.1 
 
 		 457 aa  236  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  40.2 
 
 		 437 aa  233  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  44.55 
 
 		 427 aa  232  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  45.74 
 
 		 435 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  40.15 
 
 		 442 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  38.63 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  34.27 
 
 		 447 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_004310  BR0573  amidase  37.41 
 
 		 407 aa  216  8e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0058  amidase  39.07 
 
 		 443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.633251  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4084  amidase  38.72 
 
 		 460 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  37.5 
 
 		 440 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  37.39 
 
 		 463 aa  206  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  38.39 
 
 		 465 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  33.78 
 
 		 464 aa  202  8e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0143  amidase  37.53 
 
 		 441 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0981668  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  35.67 
 
 		 463 aa  199  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1493  amidase  37.31 
 
 		 436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.53 
 
 		 461 aa  194  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  35.41 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1721  amidase  43.06 
 
 		 427 aa  189  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0870166  normal  0.409578 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  29.81 
 
 		 470 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2027  Amidase  37.45 
 
 		 475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2671  amidase  39.62 
 
 		 441 aa  177  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  33.49 
 
 		 458 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  30.67 
 
 		 470 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  33.84 
 
 		 457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2436  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.46 
 
 		 486 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2093  hypothetical protein  36.84 
 
 		 477 aa  173  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.59 
 
 		 475 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  35.06 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  37.23 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0061  amidase  36.41 
 
 		 443 aa  171  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222867  hitchhiker  0.0000105372 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13411  amidase amiD (acylamidase)  34.92 
 
 		 475 aa  170  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  34.17 
 
 		 466 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  34.49 
 
 		 467 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  34.49 
 
 		 467 aa  170  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  34.49 
 
 		 467 aa  170  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  34.49 
 
 		 467 aa  170  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  35.27 
 
 		 467 aa  169  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  34.49 
 
 		 454 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1387  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  32.19 
 
 		 467 aa  169  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593725  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  34.49 
 
 		 467 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>