215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3142 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  100 
 
 
812 aa  1679    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0920  peptidase S45, penicillin amidase  38.83 
 
 
825 aa  565  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4813  penicillin amidase  39.23 
 
 
790 aa  555  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.911238  normal  0.40468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  28.59 
 
 
807 aa  208  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  31.28 
 
 
783 aa  203  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  29.27 
 
 
803 aa  202  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  31.19 
 
 
769 aa  200  7.999999999999999e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  29.74 
 
 
821 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  26.79 
 
 
770 aa  194  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  31.29 
 
 
779 aa  190  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  26.31 
 
 
855 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  26.34 
 
 
782 aa  186  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  28.81 
 
 
804 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  26.03 
 
 
837 aa  181  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.97 
 
 
796 aa  180  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  26.03 
 
 
837 aa  180  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.97 
 
 
796 aa  180  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  25.76 
 
 
796 aa  179  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  25.88 
 
 
823 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  27.92 
 
 
827 aa  179  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  25.88 
 
 
837 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  25.88 
 
 
837 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  26.03 
 
 
837 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  25.88 
 
 
837 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.63 
 
 
796 aa  178  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  25.51 
 
 
796 aa  177  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  28.44 
 
 
817 aa  177  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  28.02 
 
 
854 aa  177  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.76 
 
 
796 aa  177  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  29.42 
 
 
789 aa  177  9e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.85 
 
 
796 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.6 
 
 
796 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  27.68 
 
 
827 aa  176  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  25.88 
 
 
823 aa  174  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.13 
 
 
796 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  25.76 
 
 
796 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  25.47 
 
 
809 aa  173  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  25.47 
 
 
809 aa  173  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  27.99 
 
 
854 aa  172  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  25.73 
 
 
847 aa  172  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  25.03 
 
 
806 aa  171  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  26.84 
 
 
843 aa  170  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  29.36 
 
 
822 aa  168  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  26.77 
 
 
818 aa  167  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  26.66 
 
 
857 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  27.68 
 
 
792 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  24.39 
 
 
812 aa  165  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  28.34 
 
 
809 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  25.99 
 
 
841 aa  163  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  26.67 
 
 
785 aa  162  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  28.48 
 
 
807 aa  162  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  30.2 
 
 
809 aa  160  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  28.5 
 
 
821 aa  159  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  26.5 
 
 
787 aa  158  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  27.37 
 
 
829 aa  154  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  24.31 
 
 
811 aa  154  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  26.35 
 
 
761 aa  153  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2701  peptidase S45 penicillin amidase  26.36 
 
 
820 aa  153  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066786  decreased coverage  0.00737149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  27.53 
 
 
809 aa  152  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  24.14 
 
 
826 aa  152  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  24.31 
 
 
808 aa  152  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  26.09 
 
 
774 aa  151  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  26.4 
 
 
810 aa  151  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  25.86 
 
 
903 aa  150  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1853  Penicillin amidase  26 
 
 
926 aa  150  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.267516 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  25.53 
 
 
795 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  27.97 
 
 
795 aa  148  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4877  Penicillin Amidohydrolase  37.24 
 
 
248 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  27.21 
 
 
795 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  24.59 
 
 
823 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  27.27 
 
 
858 aa  147  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  24.59 
 
 
823 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  26.96 
 
 
788 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  28.29 
 
 
787 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  26.94 
 
 
788 aa  145  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  26.87 
 
 
864 aa  144  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  27.43 
 
 
818 aa  142  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  25.67 
 
 
795 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3459  peptidase S45 penicillin amidase  27.6 
 
 
885 aa  140  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0402135  hitchhiker  0.000204801 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  26.19 
 
 
786 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  26.61 
 
 
724 aa  137  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  23.93 
 
 
821 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  23.51 
 
 
795 aa  137  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  24.71 
 
 
810 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  27.26 
 
 
784 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  24.43 
 
 
827 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  24.06 
 
 
803 aa  135  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4754  peptidase S45 penicillin amidase  26.78 
 
 
792 aa  135  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  25.04 
 
 
848 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  25.26 
 
 
787 aa  134  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  25.24 
 
 
813 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1174  penicillin amidase  24.71 
 
 
874 aa  129  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.141613 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  25.42 
 
 
844 aa  127  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  26.06 
 
 
819 aa  127  8.000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  26.04 
 
 
712 aa  126  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  25.77 
 
 
819 aa  125  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2028  putative penicillin amidase  25.93 
 
 
790 aa  124  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2114  penicillin acylase-like protein  26.26 
 
 
774 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  26.64 
 
 
870 aa  123  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2008  putative penicillin amidase  25.74 
 
 
790 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.276522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>