More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3059 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3059  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  616  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  40.94 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4560  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.788363  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  40.62 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  36.09 
 
 		 335 aa  208  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 		 298 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  39.46 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3953  transcriptional regulator, LysR family  39.45 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 301 aa  205  7e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 298 aa  205  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2116  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 305 aa  205  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0265238 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1871  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1107  transcriptional regulator, LysR family  39.19 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2375  transcriptional regulator, LysR family  38.8 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00507322  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2297  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000212474  hitchhiker  0.000857441 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2719  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5125  transcriptional regulator, LysR family  39.47 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.64 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 313 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 300 aa  198  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3220  transcriptional regulator, LysR family  39.24 
 
 		 293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2936  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 298 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 296 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0279  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 		 297 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4138  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 296 aa  195  7e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0279  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 		 297 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6523  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.714407 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 299 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0984  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1541  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.827921  normal  0.805114 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6239  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2002  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00230596  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 303 aa  192  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6200  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 316 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0503075 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1967  transcriptional regulator, LysR family  38.57 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256766 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6676  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 316 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.454387  normal  0.341133 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5833  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 316 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3105  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 293 aa  192  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0260  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.026779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5166  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6527  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3571  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 317 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368621  normal  0.292883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 298 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 301 aa  188  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1833  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 294 aa  188  9e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3940  transcriptional regulator, LysR family  38.64 
 
 		 295 aa  188  9e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5327  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0620404 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0517  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6112  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1448  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 302 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0364851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0988  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 302 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29091  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1470  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 302 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 313 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  39.12 
 
 		 293 aa  186  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 313 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 313 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 303 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0309  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765891  normal  0.171881 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 300 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6627  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.184966 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5752  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 313 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.515576 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5996  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 313 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.48899 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2818  transcriptional regulator  38.49 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04020  Transcriptional regulator, LysR family  36.64 
 
 		 323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.010464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1541  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0104  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2671  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1072  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.165542  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1264  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1083  transcriptional regulator, LysR family  39.19 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0122  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1228  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 		 305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1395  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.465042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>