More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6627 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6627  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
308 aa  623  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.184966 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6527  LysR family transcriptional regulator  64.69 
 
 
313 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5996  LysR family transcriptional regulator  65.12 
 
 
313 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.48899 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6200  LysR family transcriptional regulator  64.17 
 
 
316 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0503075 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5327  LysR family transcriptional regulator  65.99 
 
 
317 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0620404 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5833  LysR family transcriptional regulator  64.17 
 
 
316 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6676  LysR family transcriptional regulator  63.84 
 
 
316 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.454387  normal  0.341133 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5752  LysR family transcriptional regulator  64.78 
 
 
313 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.515576 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  58.14 
 
 
312 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  58.47 
 
 
312 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1581  LysR family transcriptional regulator  56.48 
 
 
312 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457037  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  56.91 
 
 
313 aa  349  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  56.91 
 
 
313 aa  349  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  56.11 
 
 
313 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  56.11 
 
 
313 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  56.11 
 
 
313 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  56.11 
 
 
313 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2624  transcriptional regulator  55.48 
 
 
313 aa  340  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210848  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  55.78 
 
 
313 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1679  LysR family transcriptional regulator  54.82 
 
 
313 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1469  LysR family transcriptional regulator  54.49 
 
 
313 aa  338  9e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1701  LysR family transcriptional regulator  54.49 
 
 
313 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0750  LysR family transcriptional regulator  54.49 
 
 
313 aa  338  9e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.63163  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0936  transcriptional regulator  54.49 
 
 
313 aa  338  9e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434313  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1855  transcriptional regulator  54.49 
 
 
313 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0412  LysR family transcriptional regulator  54.49 
 
 
313 aa  338  9e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4584  LysR family transcriptional regulator  55.15 
 
 
315 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143082  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1262  LysR family transcriptional regulator  54.82 
 
 
315 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.902208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4461  LysR family transcriptional regulator  54.82 
 
 
315 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1210  putative transcriptional regulator  54.93 
 
 
317 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0865  LysR family transcriptional regulator  53.82 
 
 
315 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04020  Transcriptional regulator, LysR family  54.15 
 
 
323 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.010464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13510  LysR family transcriptional regulator  54.28 
 
 
317 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0937  LysR family transcriptional regulator  52.1 
 
 
322 aa  315  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1216  transcriptional regulator, LysR family  53.49 
 
 
315 aa  309  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2420  LysR family transcriptional regulator  48.82 
 
 
334 aa  309  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0259227 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1044  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  53.16 
 
 
332 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.865685  normal  0.351691 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2329  LysR family transcriptional regulator  49.01 
 
 
354 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1646  LysR family transcriptional regulator  49.01 
 
 
354 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1112  LysR family transcriptional regulator  49.01 
 
 
336 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358465  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0872  LysR family transcriptional regulator  48.68 
 
 
336 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0596  LysR family transcriptional regulator  48.68 
 
 
336 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1839  LysR family transcriptional regulator  48.68 
 
 
336 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4797  transcriptional regulator, LysR family  49.84 
 
 
331 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0282773  hitchhiker  0.00000720419 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1025  LysR family transcriptional regulator  48.36 
 
 
336 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951762  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4638  transcriptional regulator  51.63 
 
 
314 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52930  transcriptional regulator  51.31 
 
 
314 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30988  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1864  LysR family transcriptional regulator  49.01 
 
 
331 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708451  normal  0.0358907 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4285  LysR family transcriptional regulator  47.7 
 
 
315 aa  288  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.300927 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4214  LysR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
315 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.383155 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4325  LysR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
315 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5074  LysR family transcriptional regulator  49.34 
 
 
332 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119711  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4041  LysR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
315 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3740  LysR family transcriptional regulator  47.04 
 
 
315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3196  LysR family transcriptional regulator  47.04 
 
 
315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1681  LysR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
315 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446962  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3585  LysR family transcriptional regulator  52.74 
 
 
312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364205  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1142  LysR family transcriptional regulator  47.56 
 
 
323 aa  281  9e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1196  LysR family transcriptional regulator  47.56 
 
 
323 aa  281  9e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.191376  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1489  LysR family transcriptional regulator  47.56 
 
 
323 aa  281  9e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1404  LysR family transcriptional regulator  47.56 
 
 
323 aa  281  9e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0157  LysR family transcriptional regulator  47.56 
 
 
323 aa  281  9e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820068  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0435  LysR family transcriptional regulator  47.56 
 
 
323 aa  281  9e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231747  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4120  LysR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
323 aa  279  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0008  transcriptional regulator  47.56 
 
 
431 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636727  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1305  LysR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
322 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1394  LysR family transcriptional regulator  47.23 
 
 
430 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4426  LysR family transcriptional regulator  46.73 
 
 
322 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5764  LysR family transcriptional regulator  46.41 
 
 
322 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0237  putative transcriptional regulator  47.54 
 
 
355 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4540  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 
322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29008  normal  0.0118827 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3964  LysR family transcriptional regulator  46.41 
 
 
322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0669221  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3828  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 
322 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224143  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1113  LysR family transcriptional regulator  46.69 
 
 
318 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.293194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01980  LysR family transcriptional regulator  47.54 
 
 
312 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.445097 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10730  transcriptional regulator, LysR family  47.51 
 
 
311 aa  262  6e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3043  LysR family transcriptional regulator  44.77 
 
 
327 aa  259  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.696334  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5836  LysR family transcriptional regulator  45.3 
 
 
329 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5024  LysR family transcriptional regulator  45.3 
 
 
329 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205227  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4343  LysR family transcriptional regulator  44.95 
 
 
327 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2804  LysR family transcriptional regulator  45.51 
 
 
308 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2931  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 
352 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27400  LysR family transcriptional regulator  43.19 
 
 
323 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4290  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
328 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3189  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
328 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4971  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
328 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0570046  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2317  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
315 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2866  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
310 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2435  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
310 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3493  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
310 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.911238  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2278  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
310 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1894  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 
324 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
305 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5702  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
320 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0313513 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  40.28 
 
 
305 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 
304 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3280  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 
303 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2375  transcriptional regulator, LysR family  38.26 
 
 
301 aa  192  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00507322  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0137  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
302 aa  192  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>