More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1453 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1453  major facilitator transporter  100 
 
 		 484 aa  932    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0436  major facilitator transporter  52.64 
 
 		 474 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1623  major facilitator transporter  53.71 
 
 		 467 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374459  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1278  major facilitator superfamily protein superfamily  53.85 
 
 		 467 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0634379  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1591  major facilitator transporter  53.38 
 
 		 467 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1508  major facilitator transporter  51.97 
 
 		 467 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0088  major facilitator transporter  51.97 
 
 		 467 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2324  putative transport transmembrane protein  51.1 
 
 		 475 aa  355  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0485  major facilitator superfamily MFS_1  48.82 
 
 		 486 aa  339  5.9999999999999996e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0742  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 474 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368035  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0895  major facilitator superfamily MFS_1  42.58 
 
 		 479 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4933  transport transmembrane protein  35.22 
 
 		 479 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3015  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 465 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.0182564 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3000  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 465 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3046  major facilitator superfamily transporter  38.65 
 
 		 465 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.958092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3349  major facilitator superfamily transporter  36.27 
 
 		 473 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2807  major facilitator superfamily MFS_1  35.32 
 
 		 474 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11650  drug efflux membrane protein  34.76 
 
 		 471 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.306969 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1255  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 492 aa  203  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269509  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0847  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362439  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1028  MFS permease  31.35 
 
 		 484 aa  180  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0361  multidrug resistance efflux protein  26.25 
 
 		 468 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26743  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.15 
 
 		 676 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.34 
 
 		 682 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.34 
 
 		 682 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.34 
 
 		 682 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.56 
 
 		 495 aa  116  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3797  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 461 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 548 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 496 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  26.63 
 
 		 537 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6047  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 515 aa  113  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  26.63 
 
 		 537 aa  113  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.82 
 
 		 680 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.32 
 
 		 495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4090  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 		 685 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.47 
 
 		 491 aa  111  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  26.15 
 
 		 476 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.19 
 
 		 489 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.23 
 
 		 650 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.91 
 
 		 537 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  26.15 
 
 		 537 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  26.15 
 
 		 537 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  26.15 
 
 		 537 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  26.15 
 
 		 537 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 		 491 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 496 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0637  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.02 
 
 		 531 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.62 
 
 		 532 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.92 
 
 		 593 aa  108  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 500 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3679  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 523 aa  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4819  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 489 aa  107  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.09 
 
 		 519 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.83 
 
 		 569 aa  107  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.81 
 
 		 537 aa  106  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.64 
 
 		 697 aa  106  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08610  arabinose efflux permease family protein  29.7 
 
 		 471 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.54 
 
 		 539 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.18 
 
 		 538 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 490 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 486 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1830  major facilitator superfamily drug efflux transporter  27.06 
 
 		 538 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.49 
 
 		 495 aa  104  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2304  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.44 
 
 		 549 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 502 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2384  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.44 
 
 		 531 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 489 aa  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0173  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.44 
 
 		 531 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2775  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.44 
 
 		 531 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847673  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  27.06 
 
 		 548 aa  103  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.67 
 
 		 538 aa  103  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.3 
 
 		 541 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1216  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 462 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0290926  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1084  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.471807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.44 
 
 		 549 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0669  putative multidrug transporter  28.44 
 
 		 531 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0653  putative multidrug transporter  28.44 
 
 		 531 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.433513  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 497 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.02 
 
 		 554 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.55 
 
 		 678 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.09 
 
 		 501 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.11 
 
 		 890 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000517573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2812  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.94 
 
 		 1102 aa  101  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.220309 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2926  multidrug transporter, putative  31.55 
 
 		 519 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0138273  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2939  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 500 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11217  MFS toxin efflux pump (AflT), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12620)  27.57 
 
 		 620 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.410395  decreased coverage  0.00637079 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2100  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 		 449 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1717  MFS transporter  26.23 
 
 		 462 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1220  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 		 450 aa  99.8  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 500 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01786  transport transmembrane protein  31.29 
 
 		 537 aa  99.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0541  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.38 
 
 		 549 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1959  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 488 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.789773  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 481 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 		 484 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 487 aa  99  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2150  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 480 aa  99  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.308405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>