270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0604 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0604  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 416 aa  852    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0808  Phospholipase D  68.45 
 
 		 446 aa  580  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  63.2 
 
 		 413 aa  531  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1024  phospholipase D family protein  62.72 
 
 		 422 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  26.1 
 
 		 502 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0270  phospholipase D  24.46 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.26 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.48 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1408  conserved hypothetical cardiolipin synthase  23.91 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1716  GTP-binding protein  23.91 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2403  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.71 
 
 		 586 aa  66.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.103504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.58 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.58 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  26.67 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.36 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.86 
 
 		 487 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.62 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  26.36 
 
 		 476 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  23.71 
 
 		 484 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.62 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  23.88 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.09 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.17 
 
 		 551 aa  61.6  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  25.86 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.82 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  26.71 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  24.27 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.6 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  28.49 
 
 		 502 aa  59.7  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  26.86 
 
 		 491 aa  58.9  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.71 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  24.44 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3849  cardiolipin synthetase 2  26.32 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.45957  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  27.46 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.11 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  26.23 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4114  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.43 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.3 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  27.73 
 
 		 487 aa  58.2  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.72 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.43 
 
 		 526 aa  57.8  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0467  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.11 
 
 		 534 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0844  phospholipase D/transphosphatidylase  23.12 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0550456 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  21.01 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  26.8 
 
 		 471 aa  57  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  22.97 
 
 		 556 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  24.18 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  26.04 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  25.15 
 
 		 477 aa  57  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.12 
 
 		 472 aa  57  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  26.02 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  25.63 
 
 		 489 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  24.56 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.01 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  25.4 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  25.29 
 
 		 480 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2033  cardiolipin synthetase  23.9 
 
 		 484 aa  55.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0028874  hitchhiker  0.0000142083 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.51 
 
 		 483 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  24.61 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.38 
 
 		 560 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  26.57 
 
 		 477 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.11 
 
 		 363 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  24.93 
 
 		 485 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  24.93 
 
 		 492 aa  55.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.42 
 
 		 483 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0032  phospholipase D/transphosphatidylase  26.84 
 
 		 516 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00522964  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  25.48 
 
 		 476 aa  54.7  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  23.96 
 
 		 489 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  24.46 
 
 		 478 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  23.5 
 
 		 472 aa  54.3  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.7 
 
 		 477 aa  53.9  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0483  phospholipase D/transphosphatidylase  24.84 
 
 		 467 aa  53.9  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3852  phospholipase D/transphosphatidylase  31.33 
 
 		 263 aa  53.9  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.0109744 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  23.08 
 
 		 484 aa  53.5  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2295  cardiolipin synthetase  30.37 
 
 		 486 aa  53.5  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.38 
 
 		 476 aa  53.1  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  23.99 
 
 		 400 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.22 
 
 		 477 aa  53.1  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  26.67 
 
 		 481 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  24.92 
 
 		 479 aa  53.1  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  23.9 
 
 		 505 aa  53.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.71 
 
 		 478 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.81 
 
 		 484 aa  53.1  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  24.84 
 
 		 467 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  25.6 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  24.35 
 
 		 486 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  27.02 
 
 		 487 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  24.7 
 
 		 485 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  24.35 
 
 		 477 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  24.35 
 
 		 477 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0421  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.92 
 
 		 514 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  25.56 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1506  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.52 
 
 		 622 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0429  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.87 
 
 		 530 aa  51.6  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.27 
 
 		 478 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  25.08 
 
 		 486 aa  51.6  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2427  phospholipase-like protein  20.58 
 
 		 620 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.926405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  25.08 
 
 		 505 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  25.08 
 
 		 505 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  26.67 
 
 		 514 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>