More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0511 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0511  ABC transporter related  100 
 
 		 302 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  70.53 
 
 		 300 aa  425  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  64.01 
 
 		 327 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  59.93 
 
 		 325 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  61.79 
 
 		 302 aa  345  4e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  56.85 
 
 		 302 aa  334  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0356  ABC transporter-related protein  56 
 
 		 309 aa  331  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  49.67 
 
 		 348 aa  290  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  49.66 
 
 		 332 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  49.01 
 
 		 348 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  49.49 
 
 		 344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  50 
 
 		 348 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3994  ABC transporter related  49.33 
 
 		 345 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3869  ABC transporter related  49 
 
 		 345 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  46.55 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  42.12 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  44.04 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  42.03 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  48.89 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  41 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  45.26 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  45.26 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  45.12 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  40.67 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  39.19 
 
 		 310 aa  205  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  39.14 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  40.27 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  38.91 
 
 		 318 aa  195  9e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.21 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  36.11 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.21 
 
 		 331 aa  193  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  37.54 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  40.34 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  37.41 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  37.25 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  37.92 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  34.56 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  34.56 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  42.42 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  38.36 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  36.48 
 
 		 318 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  36.48 
 
 		 318 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  41.99 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40.53 
 
 		 309 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 747 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  38.91 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 		 304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.04 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  40.36 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  33.89 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  38.86 
 
 		 259 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  31.25 
 
 		 337 aa  159  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  31.68 
 
 		 305 aa  157  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  36.82 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  42.51 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  39.04 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  38.5 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  40.38 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  39.53 
 
 		 247 aa  155  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  36.04 
 
 		 245 aa  155  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  40.45 
 
 		 302 aa  155  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  40.69 
 
 		 339 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  33.1 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  36.36 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  37.77 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  30.41 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  30.41 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  34.98 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  43.14 
 
 		 247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  31.79 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  40.28 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  35.27 
 
 		 259 aa  153  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  35.43 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  36.07 
 
 		 250 aa  152  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  32.28 
 
 		 390 aa  152  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  39.47 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  34.98 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  37.73 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  37.91 
 
 		 273 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  40.69 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  40.69 
 
 		 318 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3105  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.68 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  39.66 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  42.23 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3165  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.68 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337194  normal  0.603146 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  43.48 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  43.06 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.68 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.43 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2050  ABC transporter related  45.03 
 
 		 236 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.492019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  36.45 
 
 		 302 aa  149  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2831  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  30.94 
 
 		 366 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2875  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.94 
 
 		 366 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1021  ABC transporter related  38.53 
 
 		 237 aa  150  4e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00128788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2860  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.94 
 
 		 366 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  31 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  30.55 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>