More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3750 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
234 aa  447  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0965608  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.39 
 
 
223 aa  211  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.35 
 
 
259 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.32 
 
 
365 aa  188  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0530  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.74 
 
 
248 aa  186  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.79 
 
 
383 aa  185  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
239 aa  122  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00775431  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
235 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.4 
 
 
225 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2400  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
253 aa  102  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  35.2 
 
 
242 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  35.2 
 
 
242 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
247 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00331942  hitchhiker  0.00525068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
253 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000671935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
280 aa  99.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02915  serine 3-dehydrogenase  39.3 
 
 
251 aa  99  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
279 aa  98.6  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
242 aa  98.6  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
279 aa  97.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 
264 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
282 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 
269 aa  96.3  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1596  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 
245 aa  95.9  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
260 aa  95.9  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61312  predicted protein  31.94 
 
 
253 aa  95.9  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243713  normal  0.492851 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.72 
 
 
230 aa  95.5  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
283 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36 
 
 
269 aa  95.1  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.95 
 
 
338 aa  95.1  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 
250 aa  94.4  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09378  conserved hypothetical protein  35.23 
 
 
282 aa  94  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.141306 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
317 aa  94  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
282 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
243 aa  94  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09357  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02370)  32.66 
 
 
258 aa  93.2  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00364064 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
279 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6322  putative short-chain dehydrogenase  34.78 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72840  putative short-chain dehydrogenase  34.78 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
271 aa  93.2  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1497  NAD/NADP dependent oxidoreductase  39.52 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.445063  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
238 aa  92.8  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
250 aa  92.8  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 
287 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09940  short-chain alcohol dehydrogenase  37.31 
 
 
264 aa  92.8  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.920602  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0122  oxidoreductase  37.5 
 
 
253 aa  92.4  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.49595  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
273 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
247 aa  92.4  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
241 aa  92  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0974  short chain dehydrogenase  37.56 
 
 
230 aa  92  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0177058  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6051  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 
221 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0202908  normal  0.993323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5135  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.61 
 
 
251 aa  92  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0452  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.98 
 
 
255 aa  91.7  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18610  short chain dehydrogenase  37.43 
 
 
263 aa  91.7  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.56588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.86 
 
 
272 aa  91.7  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.68 
 
 
250 aa  91.7  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0445  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.98 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  35.26 
 
 
284 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0854  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0159157 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.03 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
273 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  0.457646 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.45 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01740  cytoplasm protein, putative  33.69 
 
 
261 aa  90.1  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672483  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0420142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10492  short-chain type oxidoreductase  34.07 
 
 
251 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 
286 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  39.79 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02553  hypothetical protein  31.74 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 
276 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
340 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
283 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0485  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.56 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.334807  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2584  ketoreductase  37.69 
 
 
245 aa  89.4  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1632  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 
235 aa  89.4  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 
244 aa  89.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
284 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05611  short chain dehydrogenase  29.89 
 
 
244 aa  89.4  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.713488  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
239 aa  89.4  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 
306 aa  89  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
248 aa  89  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
342 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  28.44 
 
 
236 aa  89  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 
262 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05911  short chain dehydrogenase  28.16 
 
 
244 aa  89  6e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
251 aa  89  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000130997  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
244 aa  88.6  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202963  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
249 aa  88.6  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.956154 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1223  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.29 
 
 
272 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 
252 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0389  short chain dehydrogenase  37.89 
 
 
270 aa  88.6  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>