124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3680 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3680  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
266 aa  533  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0611357  normal  0.412611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5585  pentapeptide repeat protein  58.56 
 
 
258 aa  292  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2675  pentapeptide repeat-containing protein  45.69 
 
 
250 aa  225  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.33412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3823  pentapeptide repeat protein  41.15 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.199719  normal  0.0347073 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1041  pentapeptide repeat-containing protein  40.38 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2076  pentapeptide repeat-containing protein  37.91 
 
 
266 aa  152  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0171382  normal  0.301394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3732  pentapeptide repeat-containing protein  36.14 
 
 
257 aa  139  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.612833  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0945  pentapeptide repeat protein  35.29 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4160  pentapeptide repeat-containing protein  32.65 
 
 
266 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0190  pentapeptide repeat protein  45.9 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.37345e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0207  pentapeptide repeat protein  44.26 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000258172  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  47.06 
 
 
263 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 
222 aa  52  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  30.53 
 
 
386 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  29.17 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  30 
 
 
332 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6057  pentapeptide repeat protein  41.56 
 
 
126 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.965316  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  30.43 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  37.8 
 
 
576 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 
524 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1383  pentapeptide repeat protein  38.2 
 
 
327 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.100104  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  25.95 
 
 
846 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3749  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.78 
 
 
214 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127226  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  31.87 
 
 
331 aa  49.3  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  28.77 
 
 
381 aa  48.9  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  34.31 
 
 
130 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  30.43 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  30.43 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  34.88 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  30.67 
 
 
449 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  33.01 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
291 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  29.13 
 
 
168 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  33.03 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  31.73 
 
 
259 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
256 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
567 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  30.37 
 
 
343 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  31.37 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  30.37 
 
 
343 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  34.72 
 
 
635 aa  46.6  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  36 
 
 
142 aa  46.2  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  34.18 
 
 
200 aa  46.2  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  25.55 
 
 
234 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2312  pentapeptide protein  35.48 
 
 
149 aa  46.2  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0828621  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  33.78 
 
 
266 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  27.46 
 
 
319 aa  45.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  32.93 
 
 
900 aa  45.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  28.72 
 
 
408 aa  45.8  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  33 
 
 
870 aa  45.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0183  pentapeptide repeat-containing protein  26.6 
 
 
170 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2937  hypothetical protein  36.67 
 
 
393 aa  45.8  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.807989  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08151  hypothetical protein  26.6 
 
 
170 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  34.92 
 
 
340 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  35.42 
 
 
266 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  31.94 
 
 
143 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  28.29 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  34.33 
 
 
706 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  32.81 
 
 
533 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  29.79 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  31.82 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  31.18 
 
 
179 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  33.66 
 
 
184 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  34.38 
 
 
526 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  37.04 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  33.66 
 
 
515 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  36.78 
 
 
204 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  33.9 
 
 
401 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  31.48 
 
 
420 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 
197 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  31.46 
 
 
483 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  31.37 
 
 
214 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  30.19 
 
 
215 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  33.04 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  33.9 
 
 
401 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  32.81 
 
 
311 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  29.87 
 
 
903 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 
215 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  29.91 
 
 
182 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  27.16 
 
 
517 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  27.66 
 
 
168 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  38.2 
 
 
198 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0386  pentapeptide repeat protein  28.74 
 
 
509 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  37.31 
 
 
336 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  37.66 
 
 
411 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  36.23 
 
 
206 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  37.31 
 
 
336 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  24.1 
 
 
179 aa  43.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  31.19 
 
 
176 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1185  hypothetical protein  31.03 
 
 
165 aa  43.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  33.82 
 
 
607 aa  42.7  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2406  pentapeptide repeat-containing protein  46.67 
 
 
288 aa  43.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584287  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  22.4 
 
 
216 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  29.61 
 
 
245 aa  43.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  33.77 
 
 
206 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  33.77 
 
 
206 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  31.19 
 
 
176 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  32.53 
 
 
267 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  28 
 
 
225 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>