More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6057 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_6057  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
126 aa  259  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.965316  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2777  pentapeptide repeat-containing protein  45.38 
 
 
124 aa  121  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.13799  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3302  hypothetical protein  47.62 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2446  acetyltransferase  26.71 
 
 
308 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.034806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2954  acetyltransferase, GNAT family  25.9 
 
 
312 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878787  hitchhiker  0.00000560426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  38.14 
 
 
576 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2377  acetyltransferase, GNAT family  25.36 
 
 
308 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2312  pentapeptide protein  34.31 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0828621  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 
524 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  28.97 
 
 
401 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  28.97 
 
 
401 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  31.97 
 
 
333 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  31.78 
 
 
447 aa  57.4  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  27.52 
 
 
216 aa  57  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2224  GCN5-related N-acetyltransferase  24.64 
 
 
308 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0079583  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  32.43 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  30.97 
 
 
448 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  35.11 
 
 
416 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7498  pentapeptide repeat protein  30.91 
 
 
391 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 
533 aa  55.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0537  pentapeptide repeat-containing protein  35.58 
 
 
959 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.884465  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  32.04 
 
 
517 aa  55.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3749  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.24 
 
 
214 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127226  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3010  pentapeptide repeat protein  32.69 
 
 
233 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  32.99 
 
 
219 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2064  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
540 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  34.38 
 
 
336 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  34.38 
 
 
336 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2510  acetyltransferase, GNAT family  23.94 
 
 
308 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115896  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1853  pentapeptide repeat protein  34.29 
 
 
369 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150883  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  31.09 
 
 
262 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  27.83 
 
 
268 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  30.25 
 
 
262 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2167  acetyltransferase  23.94 
 
 
308 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  35.24 
 
 
408 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  32.63 
 
 
401 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0869  pentapeptide repeat protein  33.01 
 
 
290 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236368  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  32.63 
 
 
401 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2180  acetyltransferase  23.24 
 
 
308 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000230557  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  35.11 
 
 
245 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  33.64 
 
 
441 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1533  pentapeptide repeat-containing protein  32 
 
 
181 aa  52  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  32.08 
 
 
1033 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  34.02 
 
 
319 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  34.95 
 
 
256 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  32.35 
 
 
1807 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  33.66 
 
 
389 aa  52  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  32.61 
 
 
526 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  31.68 
 
 
521 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  34.34 
 
 
184 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  29.25 
 
 
291 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  29.25 
 
 
291 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  29.6 
 
 
866 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  34.41 
 
 
263 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2247  acetyltransferase  23.24 
 
 
308 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0012519  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  30.77 
 
 
381 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  30.56 
 
 
213 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  32.04 
 
 
824 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0631  pentapeptide repeat protein  37.89 
 
 
225 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2411  acetyltransferase  23.24 
 
 
308 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  36.08 
 
 
567 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5585  pentapeptide repeat protein  40.74 
 
 
258 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.09 
 
 
14916 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3680  pentapeptide repeat protein  41.56 
 
 
266 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0611357  normal  0.412611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
361 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
264 aa  50.8  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  32.41 
 
 
309 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 
449 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2429  acetyltransferase, gnat family  23.24 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.287092 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  40.43 
 
 
357 aa  50.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  32.35 
 
 
217 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  31.58 
 
 
489 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3924  pentapeptide repeat-containing protein  36.08 
 
 
238 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  31.37 
 
 
635 aa  50.4  0.000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0229  pentapeptide repeat protein  30.91 
 
 
162 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.584528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  31.07 
 
 
433 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  33.02 
 
 
277 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.1 
 
 
222 aa  50.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  36.63 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  31.63 
 
 
830 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  31.87 
 
 
900 aa  50.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  28.7 
 
 
250 aa  50.4  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  28.95 
 
 
360 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
216 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2678  pentapeptide repeat-containing protein  35.29 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  32.77 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  28.95 
 
 
360 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  28.95 
 
 
360 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  28.95 
 
 
360 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  30.39 
 
 
214 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  34.04 
 
 
607 aa  49.7  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  34.34 
 
 
215 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  28.95 
 
 
360 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  32 
 
 
343 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  32 
 
 
343 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  33.02 
 
 
225 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  32.77 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  36.04 
 
 
320 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  28.72 
 
 
340 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  28.95 
 
 
360 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>