235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3395 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3395  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  283  7e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.465123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7042  protein of unknown function UPF0047  62.69 
 
 
135 aa  180  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2358  hypothetical protein  59.7 
 
 
135 aa  174  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0335235  normal  0.0190831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1966  hypothetical protein  61.19 
 
 
142 aa  174  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387815  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1363  protein of unknown function UPF0047  65.87 
 
 
134 aa  173  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10190  conserved hypothetical protein TIGR00149  64.93 
 
 
136 aa  167  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22490  conserved hypothetical protein TIGR00149  59.7 
 
 
155 aa  166  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.282378  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3372  hypothetical protein  56.72 
 
 
151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1646  protein of unknown function UPF0047  59.7 
 
 
135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3612  hypothetical protein  55.22 
 
 
134 aa  159  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1034  hypothetical protein  55.97 
 
 
133 aa  157  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0183321 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5843  protein of unknown function UPF0047  62.79 
 
 
135 aa  156  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228828  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3764  hypothetical protein  57.04 
 
 
136 aa  155  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.434678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2345  hypothetical protein  62.71 
 
 
133 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.202939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2392  hypothetical protein  62.71 
 
 
133 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2386  hypothetical protein  62.71 
 
 
133 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2639  hypothetical protein  70.3 
 
 
129 aa  153  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12577  hypothetical protein  64.1 
 
 
129 aa  152  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0908128 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0880  protein of unknown function UPF0047  51.49 
 
 
136 aa  150  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2945  protein of unknown function UPF0047  62.69 
 
 
135 aa  149  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142491  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2870  hypothetical protein  63.36 
 
 
133 aa  142  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142366  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0539  protein of unknown function UPF0047  50.43 
 
 
157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3056  hypothetical protein  55.22 
 
 
134 aa  128  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1861  hypothetical protein  59.2 
 
 
129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0103013 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  33.59 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  32.12 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1415  hypothetical protein  34.62 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  34.68 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  31.82 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  36.84 
 
 
132 aa  72  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  35.83 
 
 
155 aa  72  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  35.34 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  37.5 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  30.6 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  33.82 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  34.33 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  35.83 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  32.09 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0627  hypothetical protein  35.77 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299074  decreased coverage  0.00428994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  35.29 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  29.32 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  33.09 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  35.71 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  38.1 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  31.34 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  35.45 
 
 
136 aa  67  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4567  hypothetical protein  36.97 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  33.07 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  26.92 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  36.36 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  34.53 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0918  protein of unknown function UPF0047  36.13 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  29.29 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  30.4 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1542  protein of unknown function UPF0047  34.19 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  35.29 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  29.41 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  35.54 
 
 
160 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  34.56 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  32.84 
 
 
134 aa  62.8  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  33.6 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  33.61 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  31.62 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  30.71 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  30.43 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1050  protein of unknown function UPF0047  28.68 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  26.81 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  34.71 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  32.37 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  33.91 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  29.27 
 
 
130 aa  60.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  29.46 
 
 
132 aa  60.8  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  32.26 
 
 
128 aa  60.5  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  35.94 
 
 
131 aa  60.1  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2724  hypothetical protein  29.2 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.277726  decreased coverage  0.0000377409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2851  protein of unknown function UPF0047  31.45 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  31.3 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  31.36 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  28.36 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  31.36 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  28.03 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  31.15 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  32.2 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  27.48 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  28.79 
 
 
129 aa  58.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  29.6 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1088  protein of unknown function UPF0047  25.19 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.977912 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  30.25 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  28.36 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  41.35 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  33.82 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  41.35 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  30.08 
 
 
130 aa  57.4  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1685  protein of unknown function UPF0047  28.67 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  27.34 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  29.1 
 
 
141 aa  57  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  30.4 
 
 
138 aa  57  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>