More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2992 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 282 aa  567  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  51.46 
 
 		 272 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  48.6 
 
 		 293 aa  247  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  48.57 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  50.18 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  46.95 
 
 		 276 aa  218  8.999999999999998e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  46.51 
 
 		 283 aa  194  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  26.35 
 
 		 271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  27.21 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  24.47 
 
 		 269 aa  103  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  26.95 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  76.56 
 
 		 132 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  23.64 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  23.55 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  23.19 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 269 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 269 aa  95.9  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  23.6 
 
 		 269 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 269 aa  95.5  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 269 aa  95.5  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  25.78 
 
 		 280 aa  90.1  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  31.58 
 
 		 276 aa  85.5  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  27.24 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 161 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  21.84 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  23.89 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  23.89 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  23.89 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0345  transcriptional regulator, MerR family  35.77 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  28.62 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  22.09 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  23.55 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 276 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  29.2 
 
 		 262 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  22.68 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  28.81 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  30.11 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  29.02 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  31.3 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  38.53 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  40.57 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  27.56 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  47.83 
 
 		 281 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  33.87 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  27.64 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  21.67 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  34.78 
 
 		 398 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  27.46 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  34.17 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  41.84 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  36.08 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  22.69 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  32.54 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  26.54 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  38.03 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  49.3 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  47.89 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  30.92 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  32.41 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  45.71 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  32.79 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  47.14 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  29.17 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  32.79 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  32.48 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  38.32 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  40.48 
 
 		 138 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  29.17 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  33.96 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 143 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>