More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0545 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  100 
 
 
408 aa  828    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  67.57 
 
 
408 aa  556  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  67.33 
 
 
410 aa  548  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  59.8 
 
 
401 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  55.3 
 
 
400 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  52.76 
 
 
401 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  52.53 
 
 
399 aa  408  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  52.76 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  55.58 
 
 
395 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  51.65 
 
 
400 aa  388  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  51.03 
 
 
399 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  49.36 
 
 
407 aa  363  3e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  47.91 
 
 
400 aa  363  4e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  48.36 
 
 
400 aa  352  7e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  48.6 
 
 
430 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  48.98 
 
 
414 aa  344  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  46.27 
 
 
402 aa  333  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  46.75 
 
 
421 aa  331  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  45.66 
 
 
400 aa  331  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  45.09 
 
 
407 aa  329  4e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  45.09 
 
 
407 aa  329  4e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  47.3 
 
 
409 aa  329  5.0000000000000004e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  48.74 
 
 
357 aa  329  7e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  47.44 
 
 
399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  45.45 
 
 
399 aa  326  5e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  44.94 
 
 
397 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  43.86 
 
 
400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  47.38 
 
 
394 aa  316  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  44.15 
 
 
403 aa  315  6e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  45.11 
 
 
408 aa  315  8e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  44.25 
 
 
398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  46.91 
 
 
406 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  46.91 
 
 
406 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  46.91 
 
 
406 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  42.82 
 
 
408 aa  310  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  42.96 
 
 
409 aa  309  5e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  45.8 
 
 
345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  44.14 
 
 
405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  43.85 
 
 
404 aa  303  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  44.5 
 
 
406 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  44.25 
 
 
409 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  41.85 
 
 
407 aa  295  7e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  43.03 
 
 
401 aa  295  9e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  43.39 
 
 
409 aa  295  9e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  45.27 
 
 
406 aa  295  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  43.07 
 
 
416 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  41.29 
 
 
409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  43.07 
 
 
400 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  42.48 
 
 
412 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  42.48 
 
 
412 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  41.04 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  41.23 
 
 
412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  42.22 
 
 
412 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  39.71 
 
 
421 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  39.71 
 
 
421 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  39.71 
 
 
421 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  39.69 
 
 
411 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  41.87 
 
 
404 aa  269  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  38.87 
 
 
424 aa  269  7e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  38.67 
 
 
406 aa  264  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  40.2 
 
 
398 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  39.8 
 
 
405 aa  265  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  39.85 
 
 
407 aa  263  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  37.53 
 
 
415 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  40.1 
 
 
405 aa  260  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  39.41 
 
 
405 aa  259  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  39.23 
 
 
415 aa  256  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  39.49 
 
 
413 aa  256  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  39.21 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  39.7 
 
 
388 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  38.26 
 
 
411 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  38.93 
 
 
406 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  38.32 
 
 
423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  38.48 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  38.19 
 
 
406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  36.8 
 
 
407 aa  242  9e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  37.78 
 
 
411 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  37.66 
 
 
410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  39.17 
 
 
402 aa  239  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  37.47 
 
 
395 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  40.1 
 
 
405 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  37.84 
 
 
397 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  38.56 
 
 
402 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  36.27 
 
 
395 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  38.68 
 
 
393 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  37.35 
 
 
398 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  40.4 
 
 
397 aa  235  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  39.29 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  38.3 
 
 
400 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  37.1 
 
 
404 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  34.48 
 
 
420 aa  229  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  38.6 
 
 
426 aa  229  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  36.93 
 
 
404 aa  229  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  38.11 
 
 
408 aa  229  9e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  36.76 
 
 
400 aa  229  9e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  37.31 
 
 
417 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  38.19 
 
 
375 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  36.2 
 
 
401 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  39.84 
 
 
395 aa  227  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  35.92 
 
 
402 aa  226  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>