119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1377 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  100 
 
 
494 aa  995    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  38.08 
 
 
523 aa  262  8e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  36.05 
 
 
514 aa  249  9e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  36.27 
 
 
518 aa  239  5.999999999999999e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1678  putative methyltransferase  32.28 
 
 
508 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1600  para protein  32.43 
 
 
486 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1897  Methyltransferase regulatory domain, predicted  32.22 
 
 
564 aa  232  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  33.05 
 
 
542 aa  230  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0277  SAM-dependent methyltransferase  41.44 
 
 
482 aa  210  5e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1637  methyltransferase, putative  35.22 
 
 
521 aa  209  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  33.02 
 
 
535 aa  204  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  34.05 
 
 
535 aa  195  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1668  methyltransferase type 12  33.64 
 
 
535 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0697  hypothetical protein  27.18 
 
 
509 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1732  hypothetical protein  33.08 
 
 
503 aa  183  7e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.228081  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1912  methyltransferase type 12  31.56 
 
 
419 aa  171  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  28.74 
 
 
1144 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 
1143 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2369  Methyltransferase type 12  28.78 
 
 
252 aa  127  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631765 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  22.53 
 
 
1116 aa  103  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0362  methyltransferase type 12  25.4 
 
 
518 aa  100  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1066  methyltransferase type 11  27.31 
 
 
511 aa  92  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0031  hypothetical protein  23.99 
 
 
510 aa  90.1  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878298  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0475  methyltransferase type 12  25 
 
 
499 aa  87.4  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1222  hypothetical protein  22.52 
 
 
499 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0351348  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0189  hypothetical protein  22.52 
 
 
499 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0465  hypothetical protein  22.52 
 
 
499 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1462  hypothetical protein  22.52 
 
 
499 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1110  hypothetical protein  22.52 
 
 
499 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3839  methyltransferase type 11  27.01 
 
 
511 aa  84.7  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0810259 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2605  hypothetical protein  22.07 
 
 
499 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1375  hypothetical protein  22.07 
 
 
499 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3078  methyltransferase type 12  23.48 
 
 
512 aa  84.3  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2227  hypothetical protein  22.79 
 
 
514 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.642129  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1398  hypothetical protein  21.18 
 
 
590 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37000  SAM-dependent methyltransferase  24.32 
 
 
488 aa  58.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0432577  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  32.63 
 
 
268 aa  57.4  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  24.37 
 
 
390 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0725  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.74 
 
 
427 aa  56.6  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0644252  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3432  hypothetical protein  19.59 
 
 
507 aa  55.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468772  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  26.67 
 
 
422 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  26.81 
 
 
276 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.28 
 
 
447 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.25 
 
 
251 aa  52  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  25.66 
 
 
395 aa  51.6  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  26.13 
 
 
399 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  25 
 
 
267 aa  50.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3461  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.56 
 
 
407 aa  50.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248427  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0913  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.07 
 
 
407 aa  50.4  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1275  putative methyltransferase  24.11 
 
 
234 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3879  Methyltransferase type 12  27.13 
 
 
359 aa  50.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  26.35 
 
 
444 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  21.68 
 
 
414 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3967  Methyltransferase type 12  27.13 
 
 
359 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000336938 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0087  SAM-dependent methyltransferase  31.62 
 
 
246 aa  49.3  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  26.42 
 
 
400 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1504  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.25 
 
 
409 aa  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.250201  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3143  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.42 
 
 
392 aa  48.5  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.860131  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  23.33 
 
 
234 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1672  Methyltransferase type 12  32.76 
 
 
265 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  26.42 
 
 
400 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1804  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.04 
 
 
422 aa  48.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.399037  hitchhiker  0.0000000665268 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  28 
 
 
209 aa  48.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  23.53 
 
 
403 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  28.43 
 
 
344 aa  47.4  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  23.08 
 
 
399 aa  47  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1065  methyltransferase type 12  22.15 
 
 
360 aa  47  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  26 
 
 
363 aa  47  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  23.33 
 
 
268 aa  47  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  25 
 
 
299 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  24.39 
 
 
441 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2019  predicted protein  33.03 
 
 
877 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0204163 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2411  methyltransferase type 11  29.52 
 
 
263 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1395  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.32 
 
 
430 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196126  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  25.37 
 
 
261 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  25.37 
 
 
261 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  29.81 
 
 
246 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3431  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.3 
 
 
403 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0050  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.53 
 
 
471 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0492  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.1 
 
 
428 aa  45.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
360 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  30.48 
 
 
262 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  30.48 
 
 
262 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36390  hypothetical protein  30.14 
 
 
316 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284313  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  25.37 
 
 
261 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  27.64 
 
 
264 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  25.37 
 
 
261 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  25.37 
 
 
261 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  25.37 
 
 
261 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  25.37 
 
 
261 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  25.37 
 
 
261 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  25.37 
 
 
261 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  27.18 
 
 
283 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  30.08 
 
 
653 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
251 aa  45.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3123  hypothetical protein  30.56 
 
 
318 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.838467  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  27.36 
 
 
268 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  27.36 
 
 
268 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
272 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  25.45 
 
 
218 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>