122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0087 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0087  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 246 aa  513  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0179  hypothetical protein  36.93 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  24.46 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  24.8 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  22.75 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  25 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  29.9 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  24.06 
 
 		 249 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  25.22 
 
 		 246 aa  52  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  25 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  22.86 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  26.76 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  26.76 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  26.76 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  26.76 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  26.76 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  26.76 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  26.76 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  26.76 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1815  methyltransferase type 11  28.23 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  22.77 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  31.62 
 
 		 494 aa  49.3  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3076  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 221 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.851189  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.22 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1095  putative methyltransferase  24.47 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  23.73 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3033  methyltransferase type 11  25.62 
 
 		 504 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3437  Methyltransferase type 11  30.21 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  21.86 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 585 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 274 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.43 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  21.46 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  26.61 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  29.69 
 
 		 518 aa  47  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  27.37 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  23.15 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.33 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  27.41 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  24.79 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.71 
 
 		 230 aa  45.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1780  methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 198 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0020102  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0881  Methyltransferase type 11  22.61 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0956  methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 487 aa  45.8  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  25.64 
 
 		 235 aa  45.8  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 634 aa  45.8  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.33 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2422  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 302 aa  45.4  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  0.0203138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  25.71 
 
 		 235 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.21 
 
 		 238 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  25.68 
 
 		 254 aa  45.4  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  25.93 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3474  Methyltransferase type 12  20.4 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  26.02 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  23.44 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.21 
 
 		 236 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  23.44 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  22.66 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0634  hypothetical protein  29.85 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00503727  hitchhiker  0.0000898788 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1549  hypothetical protein  24.29 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000157032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  26.36 
 
 		 271 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  25.47 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  27.42 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  24.82 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02290  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  25.19 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  29.77 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  27.93 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  27.13 
 
 		 295 aa  43.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  28.06 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2277  methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  22.55 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1315  methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000038587 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  22.55 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04590  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.42 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.886413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43931  predicted protein  30.61 
 
 		 279 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.59 
 
 		 238 aa  43.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  24.74 
 
 		 270 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  22.69 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  25.19 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  27.37 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3099  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.1 
 
 		 365 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>