More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0555 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  100 
 
 		 306 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  43.52 
 
 		 363 aa  263  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  38.13 
 
 		 363 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  37.79 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  38.13 
 
 		 374 aa  219  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  36.12 
 
 		 363 aa  209  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  36.55 
 
 		 363 aa  209  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  37.29 
 
 		 380 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  37.55 
 
 		 360 aa  196  3e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  34.3 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  34.3 
 
 		 313 aa  186  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  33.94 
 
 		 313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  33.94 
 
 		 313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  34.3 
 
 		 313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  33.94 
 
 		 313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  33.94 
 
 		 313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  33.94 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  33.77 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  33.22 
 
 		 321 aa  179  7e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  35.83 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  32.37 
 
 		 362 aa  155  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  32.73 
 
 		 362 aa  155  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  32.37 
 
 		 362 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  32.37 
 
 		 362 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  32.37 
 
 		 362 aa  155  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  32.37 
 
 		 362 aa  155  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  32.37 
 
 		 362 aa  155  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  32.01 
 
 		 362 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  28.66 
 
 		 313 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  29.69 
 
 		 312 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  24.92 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  26.37 
 
 		 369 aa  135  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  23.92 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  27.36 
 
 		 377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0899  ribokinase-like domain-containing protein  31.49 
 
 		 307 aa  125  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  25.97 
 
 		 372 aa  122  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  25.97 
 
 		 372 aa  122  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  23.75 
 
 		 382 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  25.39 
 
 		 302 aa  99.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  24.1 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  27.1 
 
 		 314 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  27.24 
 
 		 323 aa  90.9  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  23.44 
 
 		 295 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  26.1 
 
 		 297 aa  89.7  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  26.56 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  26.19 
 
 		 307 aa  89  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  26.59 
 
 		 308 aa  88.2  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  23.1 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  26.19 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  26.59 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  26.38 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  24.03 
 
 		 319 aa  86.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  26.46 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2170  PfkB domain protein  24.6 
 
 		 314 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.68008  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  28.73 
 
 		 340 aa  85.9  8e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  26.47 
 
 		 299 aa  85.5  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  24.72 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  23.05 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  22.75 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  20.45 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  25.17 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  31.56 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  23.32 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  23.32 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  23.32 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  24.31 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  25.69 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  22.34 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1282  putative ribokinase  19.77 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.331017 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  25.1 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  26.54 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  26.42 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  23.93 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  26.42 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  23.92 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  22.57 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  21.96 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2559  carbohydrate kinase  22.37 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270626  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  25.08 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  30.8 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  23.62 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  23.97 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  23.62 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  23.44 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  25.39 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  27.52 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  27.06 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  25.99 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  27.52 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  23.64 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  21.92 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  27.52 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  27.06 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  24.81 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  27.06 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  24.81 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  22.39 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  27.06 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  24.81 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  24.81 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>