More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3080 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 104 aa  215  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  84.62 
 
 		 104 aa  183  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  84.62 
 
 		 104 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  82.52 
 
 		 108 aa  173  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  78.85 
 
 		 104 aa  170  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  78.85 
 
 		 104 aa  166  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  75.49 
 
 		 103 aa  157  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 103 aa  114  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  42.72 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 107 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  43 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  39.42 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  42 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  42.42 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 330 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  34.38 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  31.96 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  41.05 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  45.05 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  39.58 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 89 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  37.89 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  29.59 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  37.37 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  37.93 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  42.39 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  36.08 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  32.65 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  38.89 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>