181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1153 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1153  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 267 aa  548  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1676  Sel1 domain protein repeat-containing protein  70.04 
 
 		 267 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1478  Sel1 domain protein repeat-containing protein  70.04 
 
 		 267 aa  390  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2681  exopolysaccharide production negative regulator  74.06 
 
 		 271 aa  363  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0471275  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2356  Sel1 domain-containing protein  51.15 
 
 		 263 aa  277  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0872  exopolysacchride production negative regulator exoR  50 
 
 		 267 aa  265  5e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0863  exopolysacchride production negative regulator exoR  50 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1687  Sel1 repeat-containing protein  55.23 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1754  Sel1-like  34.47 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4238  Sel1 domain-containing protein  37.1 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204319  normal  0.875894 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2765  Sel1-like protein  34.6 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2495  Sel1-like  34.39 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00300273  normal  0.506926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5367  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.71 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0613059  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3203  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.59 
 
 		 273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681346  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1811  Sel1 repeat-containing protein  37.56 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.585081  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5057  Sel1 domain-containing protein  37.44 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  hitchhiker  0.00255327 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1863  Sel1 domain-containing protein  33.8 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4455  putative exopolysaccharide regulatory protein exoR  36.45 
 
 		 240 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2805  Sel1  36.59 
 
 		 273 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.513793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1910  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.84 
 
 		 295 aa  122  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2923  Sel1 domain-containing protein  32.67 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2231  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.85 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.414205 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1685  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.77 
 
 		 280 aa  116  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1955  Sel1 domain-containing protein  31.85 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  37.59 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3011  Sel1 domain-containing protein  33.14 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  30.77 
 
 		 831 aa  65.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  29.52 
 
 		 380 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1402 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2933  tetratricopeptide TPR_2  30.29 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 		 1032 aa  62.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.34 
 
 		 684 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  30.81 
 
 		 2413 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  35.9 
 
 		 817 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2511  Sel1-like protein  33.33 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  29.14 
 
 		 685 aa  59.7  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  31.58 
 
 		 489 aa  59.7  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  32.67 
 
 		 961 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  35.54 
 
 		 380 aa  58.9  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  33.12 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.75 
 
 		 528 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1002 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  30.39 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  34.9 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  33.56 
 
 		 557 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  31.08 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  30.11 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1037 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.46 
 
 		 1493 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  31.41 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  32.7 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  31.91 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  30 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  30.12 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  29.94 
 
 		 789 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.4 
 
 		 1263 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  24.45 
 
 		 373 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  24.58 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  30.29 
 
 		 679 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 976 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  28.48 
 
 		 376 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  31.21 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  27.91 
 
 		 490 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 181 aa  53.5  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3437  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.86 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28 
 
 		 1260 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  32.37 
 
 		 208 aa  53.1  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.64 
 
 		 593 aa  52.8  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.68 
 
 		 971 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.93 
 
 		 318 aa  52.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  29.41 
 
 		 971 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  33.12 
 
 		 416 aa  52.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  27.08 
 
 		 245 aa  52.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 252 aa  52.4  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  30.16 
 
 		 410 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  30.29 
 
 		 680 aa  52  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  29.53 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.25 
 
 		 1261 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 1226 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  27.22 
 
 		 490 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  25.13 
 
 		 373 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  29.28 
 
 		 961 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 		 448 aa  50.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  27.14 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  26.79 
 
 		 329 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  29.5 
 
 		 1044 aa  49.7  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.47 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  23.28 
 
 		 693 aa  49.7  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.34 
 
 		 380 aa  49.7  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  29.5 
 
 		 1078 aa  49.7  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  28.85 
 
 		 328 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.86 
 
 		 222 aa  49.3  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.84 
 
 		 163 aa  49.3  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.61 
 
 		 328 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0215  hypothetical protein  27.15 
 
 		 385 aa  48.9  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.613438  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  28.4 
 
 		 247 aa  48.9  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30 
 
 		 272 aa  48.9  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>