More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3043 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  100 
 
 		 210 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  65.41 
 
 		 206 aa  238  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0687  hypothetical protein  60.75 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0604  YceI family protein  60.75 
 
 		 234 aa  234  6e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  36.09 
 
 		 235 aa  115  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  36.36 
 
 		 197 aa  114  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  36.36 
 
 		 197 aa  114  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  37.5 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  39.88 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  37.2 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  33.71 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  38.69 
 
 		 202 aa  111  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  33.14 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  36.46 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  35.2 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  32.98 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  36.2 
 
 		 216 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  36.36 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  36.81 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  37.87 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  34.46 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  35.6 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  35.39 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  34.68 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  33.33 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  33.7 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1154  putative lipoprotein  36.36 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0007  YceI like family protein  36.36 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  37.22 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  36.36 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0008  putative lipoprotein  36.36 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1434  YceI like family protein  36.36 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311091  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  33.33 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0009  putative lipoprotein  36.36 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.686573  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  33.54 
 
 		 190 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  29.79 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  33.15 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  32.64 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  32.34 
 
 		 196 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  33.33 
 
 		 182 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2451  YceI family protein  33.51 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  31.52 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  31.14 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  30.48 
 
 		 205 aa  91.7  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  32.29 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  33.33 
 
 		 188 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  37.36 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0765  YceI family protein  32.78 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  32.8 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  33.33 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  32.74 
 
 		 187 aa  85.5  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  28.09 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  33.51 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  28.09 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  33.16 
 
 		 188 aa  85.1  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  32.56 
 
 		 198 aa  84.7  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  32.56 
 
 		 242 aa  84.7  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  29.24 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  32.91 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  31.52 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1831  YceI  31.95 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.033679  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  32.91 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  30.3 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  31.41 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  33.13 
 
 		 192 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  33.14 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  32.53 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  30.98 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  30.99 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  32.53 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4488  YceI family protein  32.6 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  32.53 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  30.65 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  30.98 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  30.77 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  32.16 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  30.98 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  30.43 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  31.98 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  30.18 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  31.49 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  29.94 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  26.32 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  33.16 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  32.16 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  27.41 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  32.56 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  31.4 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  28.81 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  31.22 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  25.64 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3229  hypothetical protein  28.43 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474421  normal  0.780413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  28.9 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  31.22 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  31.61 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  30.18 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  31.22 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  30.72 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  30.98 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  29.38 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>