More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2343 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2343  histidine kinase internal region  100 
 
 		 361 aa  701    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.134589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0934  histidine kinase internal region  26.28 
 
 		 336 aa  110  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  26.5 
 
 		 361 aa  93.6  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0978  signal transduction histidine kinase, LytS  34.09 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3680  histidine kinase internal region  34.3 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  32.8 
 
 		 370 aa  89.7  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  27.74 
 
 		 352 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0014  signal transduction histidine kinase, LytS  27.98 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.292227 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0032  sensory transduction protein kinase AlgZ  31.47 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3669  sensory transduction protein kinase AlgZ  31.53 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147493  normal  0.157843 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  31.02 
 
 		 557 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  31.02 
 
 		 557 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  32.45 
 
 		 557 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  32.45 
 
 		 557 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  33.98 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  32.45 
 
 		 557 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  33 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  32.45 
 
 		 557 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  34.78 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  30.69 
 
 		 576 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2150  signal transduction histidine kinase, LytS  29.76 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000713054  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3090  histidine kinase internal region  31.5 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0422  signal transduction histidine kinase, LytS  32.03 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.910076 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  32.39 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2144  signal transduction histidine kinase, LytS  30.83 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0137321  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4050  signal transduction histidine kinase, LytS  30.77 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4125  signal transduction histidine kinase, LytS  30.77 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4279  signal transduction histidine kinase, LytS  30.77 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  26.42 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6407  signal transduction histidine kinase, LytS  27.57 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0037  histidine kinase internal region  29.26 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  27.07 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  24.81 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  30.81 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1541  histidine kinase internal region  28.49 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.441637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  26.23 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04139  two-component system sensor protein  32.68 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.821661  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  29.67 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  27.01 
 
 		 380 aa  73.2  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  30.48 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3719  sensor histidine kinase  37.41 
 
 		 392 aa  72.8  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  32.64 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0764  histidine kinase internal region  27 
 
 		 582 aa  72.8  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.294756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  32.62 
 
 		 389 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  29.21 
 
 		 557 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  25.93 
 
 		 578 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  31.06 
 
 		 552 aa  72.4  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  30.99 
 
 		 572 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2405  sensor histidine kinase  32.12 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0208  histidine kinase internal region  37.11 
 
 		 518 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  28.68 
 
 		 465 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0214  histidine kinase internal region  37.11 
 
 		 518 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  29.11 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  23.24 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  26.57 
 
 		 726 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  34.78 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  29.55 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0230  two-component system sensor ATPase  28.5 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.779882 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0068  signal transduction histidine kinase, LytS  30.86 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  26.43 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  28.86 
 
 		 576 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0278  sensory transduction protein kinase AlgZ  31.28 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  22.68 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0601  signal transduction histidine kinase, LytS  25 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  29.11 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  31.61 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  28.57 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  31.43 
 
 		 565 aa  69.3  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  30.68 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  28.57 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  32.31 
 
 		 607 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0848  histidine kinase internal region  31.4 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4559  signal transduction histidine kinase, LytS  31.3 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  28.78 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5336  signal transduction histidine kinase, LytS  28.57 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.339163 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1227  histidine kinase internal region  28.63 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  27.98 
 
 		 568 aa  67  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  31.82 
 
 		 565 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  31.82 
 
 		 565 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  31.82 
 
 		 565 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  31.82 
 
 		 559 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  28.99 
 
 		 356 aa  67  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  31.82 
 
 		 559 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  31.82 
 
 		 559 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  31.82 
 
 		 559 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5735  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 345 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  30.54 
 
 		 454 aa  67  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  31.11 
 
 		 394 aa  67  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  31.82 
 
 		 559 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  29.19 
 
 		 558 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1260  two-component system, sensor protein  28.24 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  27.51 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  33.01 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6581  signal transduction histidine kinase, LytS  32.47 
 
 		 541 aa  66.2  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0992  signal transduction histidine kinase, LytS  26.24 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>