153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6216 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6216  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  100 
 
 		 911 aa  1895    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0774537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2955  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.92 
 
 		 818 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0137484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4335  phosphoesterase  33.97 
 
 		 921 aa  327  8.000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284385  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6217  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.97 
 
 		 829 aa  316  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3053  hypothetical protein  32.63 
 
 		 916 aa  302  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2873  putative lipoprotein  29.97 
 
 		 954 aa  250  9e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1107  putative lipoprotein  29.97 
 
 		 954 aa  250  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2720  beta-propeller repeat-containing protein  29.97 
 
 		 954 aa  249  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.501527  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0895  hypothetical protein  30.14 
 
 		 946 aa  231  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.387916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1478  hypothetical protein  29.23 
 
 		 991 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3396  phosphoesterase  25.83 
 
 		 928 aa  221  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.220047 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2303  hypothetical protein  28.76 
 
 		 945 aa  209  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1946  lipoprotein, putative  28.76 
 
 		 945 aa  209  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0709  phosphoesterase  25.58 
 
 		 873 aa  189  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2274  hypothetical protein  25.69 
 
 		 962 aa  174  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1921  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.69 
 
 		 962 aa  174  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3230  hypothetical protein  25.45 
 
 		 931 aa  165  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2833  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.45 
 
 		 931 aa  165  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5063  putative lipoprotein  29.14 
 
 		 961 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6317  putative lipoprotein  30.92 
 
 		 963 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  37.32 
 
 		 1094 aa  76.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  34.27 
 
 		 335 aa  73.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  29.29 
 
 		 971 aa  68.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.61 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1667 aa  63.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  32.86 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  32.06 
 
 		 353 aa  62.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.71 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  26.05 
 
 		 819 aa  60.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.85 
 
 		 320 aa  59.7  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25 
 
 		 366 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.09 
 
 		 752 aa  60.1  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  33.16 
 
 		 580 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.02 
 
 		 689 aa  58.5  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.41 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.24 
 
 		 347 aa  57.4  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  24.55 
 
 		 918 aa  57.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  30.83 
 
 		 335 aa  57.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.78 
 
 		 354 aa  57.4  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.31 
 
 		 317 aa  56.6  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.21 
 
 		 354 aa  56.6  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  31.91 
 
 		 391 aa  56.2  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.26 
 
 		 318 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  32.92 
 
 		 810 aa  55.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33 
 
 		 348 aa  55.5  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.3 
 
 		 328 aa  55.1  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  28.92 
 
 		 250 aa  54.7  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.62 
 
 		 974 aa  54.7  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.4 
 
 		 348 aa  53.9  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.81 
 
 		 479 aa  54.3  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3054  phosphoesterase  33.33 
 
 		 658 aa  54.3  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.28 
 
 		 311 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  26.67 
 
 		 332 aa  53.5  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  26.95 
 
 		 487 aa  53.5  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.88 
 
 		 415 aa  53.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3013  hypothetical protein  25.53 
 
 		 330 aa  53.5  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.57 
 
 		 327 aa  53.5  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 326 aa  53.5  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.87 
 
 		 334 aa  53.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  32.12 
 
 		 314 aa  52.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.12 
 
 		 338 aa  52.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  23.56 
 
 		 329 aa  52.4  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3472  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.63 
 
 		 394 aa  52.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0103  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  38.95 
 
 		 192 aa  52.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.93 
 
 		 451 aa  52.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.07 
 
 		 821 aa  52  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.05 
 
 		 328 aa  52.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.26 
 
 		 314 aa  52  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4335  acid phosphatase  29.59 
 
 		 554 aa  52  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0005  phosphoesterase family protein  31.11 
 
 		 560 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  24.71 
 
 		 479 aa  52  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1859  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.78 
 
 		 329 aa  51.6  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.981734  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0881  phosphoesterase  30.11 
 
 		 685 aa  51.6  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2106  hypothetical protein  25.1 
 
 		 317 aa  51.2  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0370  hypothetical protein  28.07 
 
 		 284 aa  51.2  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.36 
 
 		 335 aa  51.2  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.7 
 
 		 332 aa  50.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1990  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.45 
 
 		 470 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.61 
 
 		 517 aa  50.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.07 
 
 		 328 aa  50.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0484  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.03 
 
 		 323 aa  50.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.73 
 
 		 324 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5359  acid phosphatase  29.59 
 
 		 566 aa  50.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377815  normal  0.680299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3648  acid phosphatase  31.11 
 
 		 560 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.989112  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0482  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.44 
 
 		 326 aa  49.7  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.16 
 
 		 313 aa  50.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3875  phosphoesterase  28.57 
 
 		 554 aa  50.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  normal  0.170308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.71 
 
 		 1067 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.46 
 
 		 366 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  31.01 
 
 		 457 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.74 
 
 		 318 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7053  acid phosphatase  29.59 
 
 		 567 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.847803  normal  0.202504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  37.36 
 
 		 556 aa  50.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1823  twin-arginine translocation pathway signal  31.11 
 
 		 561 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.825418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.55 
 
 		 383 aa  49.3  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.26 
 
 		 652 aa  49.7  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.43 
 
 		 325 aa  48.9  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3583  hypothetical protein  29.8 
 
 		 1189 aa  48.9  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.970923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>