251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4276 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  100 
 
 
272 aa  555  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  36.86 
 
 
256 aa  159  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  29.75 
 
 
281 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  29.06 
 
 
251 aa  89  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  31.92 
 
 
281 aa  85.9  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  29.58 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  27.82 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  30.41 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  30.17 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  33.33 
 
 
253 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  25.89 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  29.46 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  29.46 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  27.46 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  29.35 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  29.1 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  25 
 
 
280 aa  77  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  32.13 
 
 
253 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  29.63 
 
 
224 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  26.5 
 
 
278 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  28.4 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  32.06 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  29.63 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  29.27 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  28.27 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  27.92 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  25.82 
 
 
236 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  27.6 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  34.42 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  28.63 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  27.87 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  30.77 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  32.48 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  31.85 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  27.43 
 
 
262 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  25.84 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  33.77 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  27.27 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  25.84 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  24.72 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  31.46 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  27.18 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  38.61 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  30.41 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  31.6 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  27.84 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  39.18 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  29.75 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  25.98 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  28.57 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  29.44 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  26.26 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  27.47 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  35.92 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  27.16 
 
 
262 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  31.2 
 
 
253 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  26.57 
 
 
215 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  30.6 
 
 
264 aa  63.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  26.94 
 
 
301 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  30.6 
 
 
266 aa  63.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1739  hypothetical protein  29.03 
 
 
228 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  26.03 
 
 
265 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  29.34 
 
 
259 aa  62  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  26.03 
 
 
265 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  37.89 
 
 
247 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  30.1 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  26.32 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  29.56 
 
 
262 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  27.92 
 
 
214 aa  59.7  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  28.19 
 
 
264 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  26.97 
 
 
251 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  25 
 
 
282 aa  59.3  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  29.51 
 
 
261 aa  58.9  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  38.78 
 
 
256 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  36.84 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  26.98 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  27.5 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  33.61 
 
 
240 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  41.67 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  33.61 
 
 
240 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  33.61 
 
 
240 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  41.67 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  33.61 
 
 
240 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  27.22 
 
 
208 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  31.01 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  36.17 
 
 
252 aa  57  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  27.42 
 
 
282 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  26.32 
 
 
194 aa  56.2  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  28.93 
 
 
262 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  31.01 
 
 
205 aa  55.8  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  31.01 
 
 
205 aa  55.8  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  25.51 
 
 
259 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  28 
 
 
282 aa  55.5  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  31.25 
 
 
209 aa  55.5  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  24.73 
 
 
287 aa  55.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  23.4 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  35.45 
 
 
322 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  31.25 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  35.45 
 
 
322 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>