More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2604 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2604  response regulator receiver and unknown domain protein  100 
 
 		 149 aa  308  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0557258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0796  response regulator receiver protein  44.2 
 
 		 142 aa  116  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5222  response regulator receiver protein  36.77 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4150  response regulator receiver protein  37.67 
 
 		 160 aa  90.5  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4374  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 155 aa  87.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00391963  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1229  response regulator receiver protein  32.03 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0153  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364118  hitchhiker  0.0000231464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  30.22 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4149  response regulator receiver protein  27.15 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  26.57 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1286  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  31.21 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  23.65 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  28.97 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  31.94 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  32.62 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3426  response regulator receiver protein  23.49 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  26.71 
 
 		 163 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  28.97 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  27.82 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  23.45 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 		 887 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2351  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  26.17 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  28.08 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  33.86 
 
 		 1179 aa  54.7  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  26.47 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0621  DNA-binding response regulator  37.88 
 
 		 230 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0500  histidine kinase  30.65 
 
 		 940 aa  52.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5579  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 157 aa  52.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1040  response regulator receiver and unknown domain protein  33.33 
 
 		 228 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0473  response regulator receiver  37.88 
 
 		 230 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  26.67 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.36 
 
 		 1498 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0689  response regulator  37.88 
 
 		 230 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0528  two-component response regulator, citrate/malate, N-terminus  37.88 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  26.39 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  31.17 
 
 		 292 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  32 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 145 aa  52  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0058  transcriptional regulatory protein CitB  34.18 
 
 		 228 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.440261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05729  putative diguanylate cyclase  41.18 
 
 		 323 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0471  response regulator  37.88 
 
 		 230 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0596  response regulator  37.88 
 
 		 230 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  24.09 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0616  response regulator  37.88 
 
 		 230 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000121  response regulator  41.18 
 
 		 319 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0601608  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0057  transcriptional regulator CitB  34.18 
 
 		 228 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.743375  normal  0.317361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  21.77 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0056  transcriptional regulator CitB  34.18 
 
 		 228 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0057  transcriptional regulator CitB  34.18 
 
 		 228 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.651756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  36.9 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0059  transcriptional regulatory protein CitB  34.18 
 
 		 228 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0471  response regulator  37.88 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  28.37 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  26.43 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  31.18 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  27.1 
 
 		 153 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  30.15 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5022  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  26.43 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  25.5 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  23.53 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1801  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.98 
 
 		 699 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000631548  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  27.21 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0168  response regulator receiver protein  26.12 
 
 		 179 aa  50.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 148 aa  50.1  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1397  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.04 
 
 		 228 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4743  response regulator  36.36 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  32.99 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  21.09 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  28.09 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3328  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.62 
 
 		 711 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  25.18 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0722  helix-turn-helix, Fis-type  38.81 
 
 		 445 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0435  two component transcriptional regulator  30.95 
 
 		 253 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.583358  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  24.29 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2406  response regulator receiver domain-containing protein  32.86 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  28.44 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  23.74 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  25.76 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002881  response regulator  30.53 
 
 		 368 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0568  response regulator  38.33 
 
 		 368 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1726  putative PAS/PAC sensor protein  34.62 
 
 		 504 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0909206  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2693  histidine kinase  27.16 
 
 		 782 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.145264  normal  0.474998 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  24.47 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  26.73 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2799  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>