More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0489 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 256 aa  525  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  47.66 
 
 		 290 aa  236  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  46.48 
 
 		 289 aa  234  8e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  46.64 
 
 		 269 aa  226  4e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  47.22 
 
 		 252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  47.22 
 
 		 252 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  46.03 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  46.03 
 
 		 252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  46.03 
 
 		 252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  46.03 
 
 		 252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  46.03 
 
 		 252 aa  214  9e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  46.03 
 
 		 252 aa  214  9e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  45.63 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  45.63 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  50.6 
 
 		 252 aa  212  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  46.99 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  45.78 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  45.78 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  45.78 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  46.61 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  47.98 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  46.15 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  46.15 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  46.15 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  46.15 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  42.51 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  43.08 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  43.08 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  43.08 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  43.08 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  43.08 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  43.08 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  45.11 
 
 		 252 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  46.08 
 
 		 235 aa  188  9e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  46.08 
 
 		 254 aa  188  9e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  45.68 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  43.5 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  42.69 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  45.11 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  44.35 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  45.75 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  43.9 
 
 		 250 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  42.36 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  38.63 
 
 		 312 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  41.15 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  41.32 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  40.91 
 
 		 253 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  40.91 
 
 		 253 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  41.33 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  40.24 
 
 		 604 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  38.93 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  38.21 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  40.37 
 
 		 253 aa  141  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  39.01 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  29.91 
 
 		 271 aa  89.4  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  30.8 
 
 		 493 aa  87  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  34.52 
 
 		 494 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  32.83 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  32.49 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  31.47 
 
 		 479 aa  82.4  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  29.28 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  27.75 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  32.51 
 
 		 489 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  34.38 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  30.46 
 
 		 493 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  30.64 
 
 		 513 aa  79.3  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  31.33 
 
 		 492 aa  79  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  27.73 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  29.15 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  31.75 
 
 		 479 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  32.57 
 
 		 432 aa  76.3  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  31.33 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  31.28 
 
 		 479 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  30.54 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  32.1 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  29.73 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  34.45 
 
 		 513 aa  75.1  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  35.44 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  28.05 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  31.48 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  28.05 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  33.12 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  26.34 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  31.58 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  33.52 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  28.68 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  27.57 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  27.38 
 
 		 447 aa  73.2  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  32.89 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  29.76 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  29.91 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01850  mitochondrial inner membrane metallopeptidase Oma1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09730)  27.48 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  32.58 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  28.64 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  28.82 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  32.26 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  30.07 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  31.64 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  28.1 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>