256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28300 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_28300  protein chain release factor B  100 
 
 
146 aa  280  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  55.88 
 
 
139 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0828  class I peptide chain release factor  58.82 
 
 
143 aa  148  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084227  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  55.88 
 
 
140 aa  143  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.82 
 
 
143 aa  140  4e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0960  Class I peptide chain release factor  54.62 
 
 
145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2137  Class I peptide chain release factor  64.44 
 
 
145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0598  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.45 
 
 
147 aa  123  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104756  normal  0.0423062 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2228  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.53 
 
 
146 aa  121  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1977  hypothetical protein  53.96 
 
 
147 aa  117  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.15 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0556  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.07 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.908284  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.13 
 
 
142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13231  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.34 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.107731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6855  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000218203  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37860  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.17 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.259651 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14431  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
142 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3059  Class I peptide chain release factor  60 
 
 
146 aa  107  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0504323  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1249  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  60.87 
 
 
129 aa  102  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.97 
 
 
145 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.472509  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.79 
 
 
142 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0102787  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0582  Class I peptide chain release factor  45.83 
 
 
143 aa  101  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03841  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.5 
 
 
142 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.300299  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1139  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  62.28 
 
 
135 aa  100  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.668699  hitchhiker  0.0000255513 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  49.63 
 
 
146 aa  100  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0672  Class I peptide chain release factor  54.84 
 
 
164 aa  97.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22660  protein chain release factor B  51.79 
 
 
146 aa  97.1  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15800  hypothetical protein  57.69 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.25035  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.09 
 
 
138 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78098  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1387  class I peptide chain release factor  55.38 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443355  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.6 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  42.03 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2426  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.89 
 
 
138 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.89 
 
 
138 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.496568  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14580  protein chain release factor B  53.85 
 
 
149 aa  92  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.024949  normal  0.100234 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.44 
 
 
139 aa  91.3  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.04 
 
 
141 aa  90.5  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.04 
 
 
141 aa  90.5  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45 
 
 
143 aa  90.1  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.45 
 
 
144 aa  89.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1368  Class I peptide chain release factor  39.71 
 
 
151 aa  89  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.422423  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.7 
 
 
143 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.44 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.48 
 
 
139 aa  87  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2311  class I peptide chain release factor  43.36 
 
 
144 aa  87  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3342  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.96 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0535  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.81 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000252738  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  37.76 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.51 
 
 
169 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3167  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.89 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  42.25 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.69 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34690  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.42 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370131  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0550  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  31.65 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  37.06 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357715 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1151  peptide chain release factor  36.29 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.36 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.96 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1709  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.32 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1842  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.62 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.23 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0281  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.42 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4087  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  31.91 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0278  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.42 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292576  normal  0.437885 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0267  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.42 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.122717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.76 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.42 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.232254  normal  0.925704 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.82 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.82 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.82 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.42 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.430585  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3411  Class I peptide chain release factor  38.69 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.57 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0202  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.86 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0203  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.69 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  47.01 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.06 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  38.81 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2541  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.03 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1390  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.85 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3468  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.68 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.437856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.59 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.56 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.96 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.733627 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1587  protein chain release factor B-like protein  35.2 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0196  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.96 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  30.94 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0194  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.96 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0185  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.96 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00190  hypothetical protein  37.96 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.40568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00189  hypothetical protein  37.96 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0730  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.76 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2547  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.73 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.256849  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4258  class I peptide chain release factor  47.22 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3468  class I peptide chain release factor  37.23 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010501  PputW619_3229  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.78 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168853  normal  0.123551 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2298  class I peptide chain release factor  38.93 
 
 
146 aa  72  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.77 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal  0.465318 
 
 
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NC_008060  Bcen_0736  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.77 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.564723  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1217  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.77 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29015  n/a   
 
 
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