More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23800 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  80.69 
 
 		 435 aa  706    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  100 
 
 		 441 aa  849    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  75.23 
 
 		 438 aa  654    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  71.69 
 
 		 434 aa  611  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  72.71 
 
 		 424 aa  579  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  64.61 
 
 		 446 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  64.61 
 
 		 446 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  64.61 
 
 		 446 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  63.45 
 
 		 450 aa  521  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  63.47 
 
 		 442 aa  514  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  65.98 
 
 		 450 aa  509  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  60.9 
 
 		 459 aa  505  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  63.47 
 
 		 450 aa  498  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  60.09 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  59.59 
 
 		 474 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  58.12 
 
 		 450 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  57.51 
 
 		 451 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  61.05 
 
 		 445 aa  439  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  55.43 
 
 		 443 aa  423  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  53.61 
 
 		 439 aa  419  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  58 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  54.89 
 
 		 457 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  58.12 
 
 		 456 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  53.95 
 
 		 440 aa  398  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  53.5 
 
 		 478 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  53.4 
 
 		 446 aa  398  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  55.1 
 
 		 477 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  52.8 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  50.55 
 
 		 466 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  51.84 
 
 		 432 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  56.24 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  55.58 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  47.66 
 
 		 465 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  53.9 
 
 		 439 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  50.23 
 
 		 439 aa  360  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  48.84 
 
 		 427 aa  359  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  49.3 
 
 		 429 aa  359  6e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  49.07 
 
 		 417 aa  356  5e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  49.31 
 
 		 467 aa  355  5.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  48.95 
 
 		 434 aa  352  8e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  45.68 
 
 		 457 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  47.8 
 
 		 449 aa  352  8.999999999999999e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  47.04 
 
 		 405 aa  349  5e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09130  ammonium transporter  55.07 
 
 		 420 aa  348  1e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.471834  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  49.64 
 
 		 442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2526  ammonium transporter  47.22 
 
 		 424 aa  342  5.999999999999999e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  47.8 
 
 		 451 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  50.81 
 
 		 438 aa  340  4e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  46.1 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  46.83 
 
 		 488 aa  335  7e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4891  ammonium transporter  49.77 
 
 		 417 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4980  ammonium transporter  49.77 
 
 		 417 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5508  ammonium transporter  50 
 
 		 417 aa  333  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5259  ammonium transporter  49.77 
 
 		 417 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  46.01 
 
 		 431 aa  332  5e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  46.15 
 
 		 515 aa  332  8e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  46.87 
 
 		 429 aa  332  9e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  46.26 
 
 		 428 aa  331  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  45.48 
 
 		 515 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  45.22 
 
 		 410 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  47.3 
 
 		 494 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  44.42 
 
 		 461 aa  326  6e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  44.99 
 
 		 410 aa  325  7e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  44.99 
 
 		 411 aa  325  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  46.19 
 
 		 464 aa  325  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  46.01 
 
 		 489 aa  324  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  44.57 
 
 		 453 aa  324  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  45.37 
 
 		 485 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  44.76 
 
 		 410 aa  322  6e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  44.52 
 
 		 410 aa  322  8e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  45.93 
 
 		 496 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  44.76 
 
 		 410 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  44.99 
 
 		 410 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  44.76 
 
 		 410 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  44.52 
 
 		 410 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  46.28 
 
 		 444 aa  318  7.999999999999999e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  44.13 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  43.5 
 
 		 405 aa  317  4e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  45.58 
 
 		 436 aa  316  6e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  43.53 
 
 		 398 aa  315  9e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  43.72 
 
 		 449 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  43.5 
 
 		 397 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  45.07 
 
 		 402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03566  ammonium transporter  47.91 
 
 		 480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  46.56 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  44.57 
 
 		 507 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3236  ammonium transporter  46.01 
 
 		 454 aa  313  4.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  45.14 
 
 		 501 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  45.9 
 
 		 435 aa  312  7.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  45.06 
 
 		 438 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  45.06 
 
 		 438 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  45.71 
 
 		 431 aa  311  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  41.94 
 
 		 433 aa  310  2e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  44.82 
 
 		 510 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  44.01 
 
 		 462 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  44.9 
 
 		 515 aa  310  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  45.07 
 
 		 402 aa  309  5e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0014  ammonium transporter  45.73 
 
 		 455 aa  309  5.9999999999999995e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  45.12 
 
 		 438 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  44.9 
 
 		 524 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>