More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20640 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  100 
 
 		 239 aa  477  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  78.57 
 
 		 239 aa  388  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  71.61 
 
 		 253 aa  355  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  70.76 
 
 		 247 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  70.76 
 
 		 247 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  70.34 
 
 		 247 aa  351  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  70.34 
 
 		 247 aa  351  7e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  67.8 
 
 		 236 aa  325  4.0000000000000003e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  66.53 
 
 		 236 aa  318  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  65.96 
 
 		 245 aa  311  5.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  65.68 
 
 		 237 aa  307  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  62.98 
 
 		 234 aa  305  5.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  63.4 
 
 		 238 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  65.38 
 
 		 251 aa  301  7.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  62.45 
 
 		 256 aa  300  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  60.17 
 
 		 235 aa  275  5e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  60.17 
 
 		 235 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  57.74 
 
 		 237 aa  273  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  57.74 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  57.14 
 
 		 236 aa  270  1e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.89 
 
 		 234 aa  270  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  56.9 
 
 		 235 aa  268  5e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  54.89 
 
 		 233 aa  268  7e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  54.89 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  52.1 
 
 		 236 aa  266  2e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  54.47 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  54.47 
 
 		 233 aa  265  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  55.74 
 
 		 233 aa  264  7e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  56.3 
 
 		 238 aa  265  7e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.17 
 
 		 234 aa  265  7e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  56.17 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.91 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.91 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.91 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.91 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.91 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.91 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.91 
 
 		 234 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  54.89 
 
 		 239 aa  262  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.62 
 
 		 236 aa  261  4.999999999999999e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  55.51 
 
 		 234 aa  261  4.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  51.06 
 
 		 238 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  54.2 
 
 		 236 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  52.1 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.06 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  56.12 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  53.19 
 
 		 234 aa  259  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  52.97 
 
 		 234 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  52.77 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  52.77 
 
 		 234 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  53.81 
 
 		 235 aa  259  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  55.23 
 
 		 241 aa  259  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  56.96 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  52.77 
 
 		 237 aa  258  4e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.12 
 
 		 234 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  54.89 
 
 		 236 aa  258  5.0000000000000005e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  50.64 
 
 		 238 aa  258  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  50.64 
 
 		 238 aa  258  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  50.64 
 
 		 238 aa  258  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  50.64 
 
 		 238 aa  258  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3910  ABC transporter related  54.39 
 
 		 241 aa  258  8e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  51.9 
 
 		 237 aa  258  8e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  54.39 
 
 		 241 aa  258  8e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  257  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  52.77 
 
 		 238 aa  257  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  52.77 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  56.6 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  51.48 
 
 		 236 aa  257  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  52.12 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.64 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  56.6 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  56.6 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  56.6 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  56.6 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  56.17 
 
 		 259 aa  256  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  55.32 
 
 		 234 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  53.59 
 
 		 234 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  56.17 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  52.12 
 
 		 234 aa  255  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  55.51 
 
 		 258 aa  255  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0608  ATPase  57.63 
 
 		 234 aa  255  6e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  56.17 
 
 		 235 aa  254  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  56.17 
 
 		 233 aa  254  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  53.62 
 
 		 264 aa  254  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  51.26 
 
 		 236 aa  254  7e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  53.62 
 
 		 234 aa  254  8e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  53.62 
 
 		 265 aa  253  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  56.17 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.6 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  52.77 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  55.32 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  53.39 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.6 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1325  ABC transporter-like protein  53.36 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0593111 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  53.39 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  53.39 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  58.16 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>